古城,遺蹟,《聖經》:「歡迎來到末日戰場哈米吉多頓」

另一個爭議話題源自一處較古老的地層，在那裡發現了被火燒黑的碎裂骨骼，其中包括一名被倒下的牆壁砸中的年輕女孩。但在這個時期，究竟是什麼讓米吉多受此劫難？20世紀30年代的一位發掘者猜測「很可能是在大約公元前1190年的時候遭到了進擊的非利士人的燒殺」。非利士人的存在有其它的考古證據證明，但是在米吉多及其周邊地區發現的遺骸上並沒有找到箭頭或其它武器，而骨頭上也沒有刀劍留下的痕跡。另外，導致牆壁移位的力量是人力（哪怕是擁有攻城槌的人類）所不能及的。還有，根據21世紀的放射性碳測年研究，地層的年代是公元前10世紀。

Cline和其他人認為當時有過一場大地震。這類地質事件在地中海以東地區肯定有發生，比如Cline在他2014年出版的《公元前1177年：文明崩潰之年》（1177 BC: The Year Civilization Collapsed）一書中探討的公元前31年和公元1927年發生在耶利哥的兩次。然而，在沒有當時文字記錄的情況下，古時候的地震是出了名地難以證實。Cline寫道，唯一可以確定的是，那場災難「不論由何人何事而起，對當地居民來說都是末日」。

米吉多最終在公元前300年前夕遭到廢棄。至少有一位學者提出是亞歷山大大帝摧毀了這座城市，「可並沒有證據支持如此戲劇性的結局，」 Cline打趣道——雖然此地有著長期兵荒馬亂的歷史。更為可能的情形是，亞歷山大的軍隊在行軍途中經過這座高聳的無人土丘，對它已然顯赫的歷史卻是渾然不知。