中國科學院成立於1949年，是中國自然科學研究的最高殿堂，它是直屬於國務院的事業單位，其名下共有四所高水平的大學，其中有一所正在籌建中。
（一）中國科學院大學
中國科學院大學位居北京，是中國「雙一流」世界一流學科建設高校，其前身是中國科學院研究生院，2012年，中國科學院研究生院更名為中國科學院大學，2017年入選「雙一流」世界一流學科建設高校，入選的學科有化學、材料科學與工程2個，2014年，該校首次招收本科生。
據該校官網簡介顯示，中國科學院大學有專任教師3000餘名，兩院院士176人，博士生導師6786名，香蕉認為，這個數據真的是令人震驚！現有本科生近2000名，研究生5.2萬名左右，其中，博士研究生佔一半以上。
（二）中國科學技術大學
該校位居安徽省省會合肥市，直屬於中國科學院，是985、211、「雙一流」世界一流大學A類建設高校，研究型大學，其在全國多處有研究院，綜合實力好，現在，該校正在發力社科和醫科，根據該校的官網簡介顯示，該校有8個一級國家重點學科，18個安徽省一級重點學科，12個國家級重大科研機構，其中包括多個國家重點實驗室。中科大成就了合肥，合肥助力中科大騰飛！
（三）上海科技大學（共建）
這所高校由上海市主管，上海市人民政府與中國科學院共建，本質上不算是中國科學院直屬高校，該校是高起點起步，2013年正式建立，博士學位授權單位，是一所研究型大學，現有研究生（包含博士、碩士研究生）共計2800人左右， 本科生1700人左右，本科、研究生比例約為1.65:1，目標是一所創新型、研究型高水平大學。
（四）中國科學院深圳理工大學
首先，需要特別強調的是該校名是暫定名，且該校正在籌建，並不是一所已經成立的高校！據中國科學院官網消息顯示，中國科學院深圳理工大學（暫定名）啟動籌建，中科院在北方（北京）、東方（共建上海科技大學）、中部（合肥）都有高校，深入深圳，需要一所中國科學院直屬的高校，這樣，深圳理工大學應運而生了。啟動大會在深圳開幕，大會當天，中科院、深圳市各方領導蒞臨，該校的辦學定位是「研究型大學」，主要的研究方向是生物學、生物醫學、材料科學等學科，建立學院、書院、研究院「三院一體」的人才培養模式！為建設深圳做出努力！