近日,上海市疾控中心在對英國輸入的新冠肺炎確診病例進行基因測序監測中,發現1例病例的新冠病毒基因序列為B.1.1.7亞型,與近期英國報導的變異病毒基因相似。1月2日,廣東省疾控中心也在一名英國輸入確認病例中發現了B.1.1.7突變株,與英國報導的變異病毒高度相似。目前,多國已檢測到變異病毒,世衛組織也通報了其他幾種變體。
變異病毒目前如何診斷?疾病傳染性是否因此增加?多國已研發的新冠疫苗是否有效?
1月3日,上海市公共衛生臨床中心黨委書記、復旦大學附屬華山醫院傳染病科教授盧洪洲,就此次境外病毒變異問題接受紅星新聞記者採訪時表示,尚無任何證據能證明此次境外發現的病毒變異增加致病性。仍需要更多實驗室內的細胞實驗以及動物實驗進一步確認其感染性。
▲盧洪洲
是什麼促使病毒變異?
免疫脆弱人群或是發生變異關鍵
新冠病毒變異是怎麼回事?盧洪洲介紹,病毒變異指的是各種原因致使病毒的遺傳物質發生改變,比如其遺傳物質DNA/RNA上的鹼基突變。來自化學和物理等各方面的因素,均能誘發各種突變。這些突變於病毒時常有益,如HIV-1病毒,突變率達三萬分之一,如此高的突變時常導致耐藥性改變,引起治療難度增加,疫苗開發難度大以及保護作用減弱。
他補充道,病毒作為最簡單的生命體,因其遺傳物質結構簡單,更容易發生變異。這些變異主要發生在基因組增殖複製過程中。由於免疫壓力(如病毒存在的細胞免疫微環境的改變)或者病毒本身特性(如遺傳物質複製剪切發生錯誤,缺乏精準複製的能力),導致突變時刻都在發生。因此,變異可以說是病毒應對環境選擇的一種策略或者生存方式,這種變異在自然環境下是漫長而緩慢的(如形成新的準種),可隨環境壓力的增加而加快。
盧洪洲介紹,冠狀病毒(Sars-CoV-2)自大流行開始以來,每月發生一次或兩次變化,此次境外發現的變異新冠病毒(B.1.1.7) 的基因突變速度是較快的。這種病毒變異的基因編碼上共計出現了多個不同的基因突變點,包括6個同義突變,3個缺失突變和14個非同義突變,且其演化較根部距離遠。其中,有8個基因突變點發生在病毒的重要結構蛋白S蛋白即刺突蛋白上的。其中值得注意的是,501Y.V2突變是發生在RBD受體結合區發生突變,導致其與人體細胞受體ACE2結合更為嚴密。
世衛組織也通報了其他幾種變體,如D614G,它能讓病毒更具傳染性;與水貂有關的變體「Cluster 5」,可能與減少自然感染或接種疫苗後所產生的免疫保護的範圍和持續時間有關。VOC 202012/01變體,它能讓病毒更具傳染性。
是什麼樣的環境改變使得病毒變異出現呢?盧洪洲介紹,根據《Science》觀點,免疫脆弱人群可能是新冠病毒出現重大變異的關鍵。這些免疫力脆弱人群可能為新冠病毒提供了進化譜系的機會,而新冠變異也會加重該類人群原發疾病。可以說外界環境壓力,比如治療策略、疫苗策略以及宿主自身免疫環境均可成為突變的原因。
▲2020年12月29日,一名戴口罩的男子從英國倫敦的議會大廈前走過。 圖自新華社
此次境外病毒變異有何特點?
擴散範圍更廣泛,致病性有待研究
目前多國已檢測到變異病毒,但沒有報導的國家,是否就不存在病毒變異呢?盧洪洲表示,並非病毒變異在該地區不存在,而是因為受限於檢測手段和檢測力度的原因。
盧洪洲介紹,與同為呼吸道病毒的流感相比,新冠病毒的變化速度較慢。但該次境外發現的新冠病毒基因突變,檢測到大量的突變位點。較此前新冠病毒的變異來看,此次變異病毒擴散的範圍也更為廣泛。報導指出,該變異病毒比原始株傳播性高出了70%,S蛋白與人ACE2受體結合率也提高了100倍,值得指出的是,該數據的準確性仍需更多的流行病學調查精準其結果,也需要更多實驗室內的細胞實驗以及動物實驗進一步確認其感染性。
病毒變異是否導致疾病加重呢?對此,盧洪洲認為,目前為止,新冠病毒新變異看上去並沒有導致感染者出現比之前病毒感染者更重的病症,現在還沒有任何證據能證明這種病毒新變異引起致病性增加,該方面仍然是有待更多研究。目前來看,即便這幾種病毒新變異的傳染性真的更強,疫情的總體進程並不會因此而改變。
盧洪洲強調,至少,在我國疫情繼續嚴格防控的策略下,其對疫情的總體進程的影響還是樂觀的。疫情的總體進程,還受到公共衛生策略中的防護措施以及疫苗推進等多方面的影響,因此,民眾在不掉以輕心的同時,不必形成恐慌。
病毒變異不影響目前的檢測方法
但對檢測手段提出更多要求
對於新冠病毒變異,如何進行診斷?盧洪洲介紹,首先,目前我國主流核酸檢測試劑針對的是雙靶標基因,即N基因和ORF1ab基因,比起單靶基因擴增更有效。目前在境外出現的這一新變異株的S蛋白基因變異,尚存的檢測手段,不會影響核酸試劑的敏感性和特異性。
「新冠大流行期間,各國科學家都對Sars-CoV-2基因組進行了測序。測序手段不斷更新提升了我們對病毒基因組奧秘的掌握。」盧洪洲表示,目前,雖然單用新冠病毒的常規核酸檢測對新冠變異株還不能進行鑑別診斷,從科學研究和醫療診斷的角度,病毒變異對檢測手段提出了更多的要求。但是在常規核酸檢測技術-PCR確診陽性並臨床診斷陽性的基礎上,利用高通量基因組/轉錄組測序技術,確定新冠病毒的突變特徵。通過對基因組片段PCR產物sanger測序進一步驗證突變位點。通過多種檢測手段的結合使用,推動對病毒的遺傳密碼的進一步認知。
尚不能確認疫苗對病毒變異無效
仍需做好防護措施
我國新冠疫苗已獲批上市,北京、上海等地已啟動疫苗接種工作。面對新冠病毒變異,疫苗接種是否有效?對此,盧洪洲介紹,注射了疫苗後,人體免疫系統會對整個病毒作出反應包括產生抗體,乃至調動細胞免疫等來達到抗病毒的效果。抗體並不是僅僅針對發生變異的那一段,因此,還不能確認現在出來的疫苗對這種病毒新變異B.1.1.7無效。更多的實驗室結果有待驗證,對此持積極態度。
根據北京青年報報導,中國疾控中心免疫規劃首席專家、主任醫師王華慶表示,根據世衛組織最新發布的信息,沒有看到疫苗效果因病毒變異產生影響,世衛組織也一直持續關注這個問題。
盧洪洲說,從流感疫苗研發的進程來看,病毒變異的產生也推動著疫苗研發的不斷前進。病毒變異也能促使更有效、更安全的疫苗不斷更新和研發。就目前的情況來看,依然建議和鼓勵民眾疫苗接種,降低感染風險。
那麼,面對變異新冠病毒,隔離防護怎麼做?對此,盧洪洲表示,病毒變異以及何種變異會導致疾病加重等重大科學問題,仍然有待更多研究數據解答,因此,需堅決抵制變異株更大範圍內的傳播。他提示,民眾仍然需要維繫好嚴格的物理隔離措施,如保持一定社交距離,做好個人防護如出行佩戴好口罩,注意手的清潔和消毒等。
盧洪洲補充道,對於出現的有重大意義的變異,科研層面應積極推進基礎研究,醫療診斷技術和訓練也應不斷提升。「早發現、早報告、早隔離、早治療」的防控體系仍然是行之有效的阻斷傳播流行的公共衛生策略。
紅星新聞記者 張炎良
編輯 官莉
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