CypCut 提供了豐富的圖形選擇方式。最基本的操作是「點選」，在圖形上單擊滑鼠即可選中圖形。另一種更常見的操作是「框選」，拖動滑鼠在屏幕上形成一個半透明的選框來選擇圖形。「框選」分為兩種，從左向右拖動滑鼠時，顯示實線框藍色半透明矩形，只有完全 覆蓋在矩形框內的圖形才會被選中；從右向左拖動滑鼠時，顯示虛線框青色半透明矩形， 只要圖形的任何一部分位於矩形框內，圖形就會被選中。
這兩種選擇的示意圖如下。左圖為從左向右選擇，BC 將被選中，右圖為從右向左選擇，ABCD 都將被選中。靈活使用這兩種方式可以更加方便地選中您需要的圖形。
無論「點選」還是「框選」，如果在選擇的同時按下Shift 鍵，則可以在不清除原有選擇 的情況下新增或取消選擇圖形。
單擊「選擇」按鈕，會出現一個下拉菜單，通過它可以進行高級選擇操作，包括： 基礎操作：全選（Ctrl+A)、反選、複製（ctrl+c）、粘貼（ctrl+v）、剪切（ctrl+x）、取消選擇（可點擊空白區域實現）、帶基點複製（選擇一個點，粘貼時圖形與鼠 標位置關係和基點與原圖形位置關係相同）
①、圖形操作：選擇不封閉圖形，選擇相似圖形，選擇所有外模或內模，選擇所有小 於指定尺寸的圖形（需要在軟體下方的繪圖信息欄裡面輸入指定的尺寸）
②、圖層操作：選擇圖層（用於選擇一個圖層裡面的所有圖形）、鎖定背景。
③、「禁止快速拖動和複製」勾選後將不再允許用戶拖動、複製、旋轉圖形，從而避 免使本已排好的圖形由於誤操作發生錯位。
其中「選擇相似圖形」允許您選擇繪圖板上所有看起來接近的圖形，例如先選擇一個5mm 的圓，然後單擊「選擇相似圖形」就可以選擇所有 5mm 的圓；