故事的主人公殺老師，他出生在一個戰火紛飛的貧民窟中，殘酷的生存環境讓他堅信著人被殺就會死的真理。而也因此為了能繼續的活下去，他選擇成為了一名殺手。而具備天賦的他很快就嶄露頭角，他憑藉精湛的技術、廣泛的知識、健壯的身體奪去了數千人的性命，也因此獲得了死神這個頭銜。但是一件令他出乎意料的事情卻徹底改變了他的人生。他被當時唯一一個人也是最信任的徒弟背叛了，他的徒弟出賣了他，也奪去了他死神的名號。
由於自身強大的身體素質，以及作為殺手的他沒有任何身份，所以其最終被政府接收用來進行非人道的實驗。即使他各方面都被政府小心提防著，沉著冷靜的他卻仍然尋找著離開的方法。但一個人的出現打破了他的思緒，為他黑暗的人生中帶來了一縷陽光。那個人便是雪村亞久裡，同時也是三年級e班的老師，雪村老師有著溫柔的笑容，性感的身材，但卻有些笨拙，品味也有些差，可不幸的是她被家裡許配給了該實驗的負責人柳澤，成為了他的未婚妻，兩個人毫無愛情可言，柳澤處處嫌棄著雪村，也因此讓其看守著監牢，即使送命了也不會對實驗造成影響。他總是粗暴著對著雪村，但雪村卻還是勉強擠出微笑，而在雪村心中，她有著自己的精神支柱，也就是她的那些學生們。
在看守殺老師的過程中，雪村毫不吝嗇的表現出了對學生的關心以及愛護，而一邊的殺老師則總是會給笨笨的雪村出謀劃策，時間一久兩個人之間也產生了深厚的情誼，而在這個過程中，殺老師也因為人體的實驗，身體發生了極大的轉變而心裡也因為雪村，終於明白了被他人重視的感覺，打開了塵封多年的心扉。
就這樣快要到一年時，新一屆的初三學生，也因為學習成績差或品德不端正被其他班級拋棄，丟到了E班裡；許多學生早就因此放棄了自己，但雪村卻還是看到了他們每個人的閃光點，雖然她傾盡了全力，卻仍然無法驅散那些被拋棄的學生的臉上那絕望的神情，不久後的一天，正是兩人相遇的一周年，雪村知道殺老師沒有生日，所以她希望能將他們相遇的那天作為他的生日。並買了一根領帶作為禮物，於是她也向殺老師訴說了自己的苦惱，兩個人此時已經互相明了了彼此的心意，但是也就是在這時，在月球進行同樣實驗的一隻小白鼠發生了變異，將整個月球炸去大半，柳澤趕忙測定殺老師自曝的時間。發現會在一年之後，殺老師會連同地球一同毀滅，而唯一的辦法就是其爆炸前將其殺死，於是柳澤連同政府決定要迅速將之處絕。
但此時的殺老師早就已經可以熟練使用觸手的力量，破壞了關押他的房間，強大的殺老師憑藉極快的速度和極大的力量，將來襲的軍人以及實驗室都破壞殆盡。