實際上日本人同現代漢人，並沒有太多的血緣聯繫。
日本人大體是繩文人和彌生人構成。
繩文人生活於舊石器時代後期，時代為公元前145世紀至公元前10世紀左右。
經過現代基因分析，繩文人同中國漢人是有著共同祖先的分支。
但繩文人是公元前10世紀來到日本的，也就是說他們早就在周代之前就到達日本。
而商代，中國文化還出於啟蒙階段，甚至還沒有信史。
通過繩文人來認祖歸宗，顯然是荒謬的。
另外，繩文人其實同漢人基因還是有很大區別的，反而與現今的南北韓人、臺灣原住民等族群相近。
而關鍵的是公元前300年左右至公元後250年左右，達到日本的彌生人。
一般認為彌生人，才是和中國漢族直接擁有共同祖先的。
但日本的研究認為，彌生人其實也分為兩類，一種主要攜帶男性攜帶單倍群—O2b，一種主要攜帶單倍群—O3。
但O2b基因主要來自朝鮮半島，而O3才是漢人的常見基因，他們是在鐵器時期前後，逐步進入日本的。
O3基因的日本人不是很多，大約佔到一二成。
所以要說認祖歸宗，也只有這些人才能有資格。
而現代日本人其實是彌生人和繩文人的混血，所以血緣比較混亂，其實沒有嚴格意義上的唯一祖先。
認祖也是意義不大。