科研新手會用到的Image J使用方法總結

2021-02-13 實驗萬事屋

Hello,大家好,我是貧窮激發創造力的科研鱉,小鱉我斥巨資購買的VPN從油管學習Image J的用法,分享給親們~

Image J測量western blot蛋白電泳灰度值

之前我們也分享過很多這類的帖子,點擊查看。

你真的用Image J測到了WB條帶灰度值嗎?

不再需要PS!教你Image J的圖片修飾……

同學,WB的灰度值測量再了解一下?

之前也講過,點擊查看。

Transwell- image J五步分析法與經驗總結

選一張肺部的Masson三色染色圖,染色結果為:膠原纖維呈藍色(如光綠液染色為綠色),胞漿、肌肉、纖維素、神經膠質呈紅色,胞核黑藍色。對 Masson 染色的分析通常是計算膠原容積分數 (Collagenvolume fraction,CVF),即膠原陽性的藍色面積與組織總面積的百分比。

1、打開 Imagej 軟體,點擊 File → Open 打開待分析 Masson 染色圖片

2、在工具欄中選擇Image按鈕→選擇Type→再選擇RGBStack按鈕,之後你的圖片將會是以下這種顯示情況

3、此時再將圖片下方的調節滑輪拉到中間或是最右邊,以獲得最佳的對比度→再選擇Image按鈕→點擊Adjust→點擊Threshold按鈕→出現的窗口如下:

4、此時只需要調節上下兩個滑輪即可對圖片的陽性染色面積進行標記

5、然後我們進入統計階段→點擊Analyze →然後Select Measurements按鈕→出現窗口後再點擊Area fraction按鈕

6、點擊Analyze按鈕→點擊measure,即可計算陽性面積百分比,圖中8.289就是所要的數據

很抱歉,電腦中沒有免疫螢光圖片,基本上的操作步驟同上,只是在threshold這一步有點差別(借用一下上一個圖片),如圖所示:在threshold窗口中,將下方滑輪滑到最右邊,上方滑輪可左右調節,調整最適合的視野,之後的計算步驟同上。

因為字數有限,所以只介紹了這幾種,如果大家覺得有幫助的話,之後我會陸續整理出Image J應用於其他實驗的具體操作步驟。希望對待大家有幫助。

延伸閱讀:

簡單的蛋白翻譯後修飾類文章的套路,做完大概12分

生活終於對我冰箱裡的蛋白樣本下手了!

不懂英語,難道用氣功來分析LncRNA結合蛋白麼?

利用 BIAcore 分析相互作用的蛋白質(下篇)——實戰篇

只要五步輕鬆解決蛋白電泳出現的彎曲條帶

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