生化危機1
二十一世紀初，『保護傘公司』成為美國最大的商業帝國，大多數市民全部在使用它們的産品。表面上公司是北美屈指可數的軍火和醫藥供應商，但公司卻有一個連內部人員都不為而知的秘密：在地底的生化實驗室裡開發非法生化病毒武器。『拉昆市』，保護傘公司的總部所在城市，城市的地底下有保護傘公司其中一個生化實驗室：『蜂巢』，裡面存有公司最重要的成果：「T病毒」與「G病毒」。一天，一名身份不明的核生化防護員走進病毒存放庫後將所有的病毒洗劫一空，也在走的時候隨手扔了一個T病毒後揚長而去，T病毒洩漏後飄進空調系統傳染給蜂巢的所有人。控制蜂巢的人工智慧電腦「紅後」探測到後將蜂巢全面封死，也開啟滅火劑殺死蜂巢裡的所有人。
生化危機2：啟示錄
前警衛艾莉絲和環保人士馬特·安德森（Matt Addison）在上一部電影中經過一系列戰鬥設法逃出喪屍爆發源頭，地下遺傳研究設施「蜂巢」（Hive）。兩人打算揭露保護傘製藥公司在蜂巢的非法實驗，但電影最後都落入保護傘控制。保護傘派工作組前往蜂巢調查情況，但喪屍很快脫離控制，並因工作組打開封鎖向附近的淙熊市蔓延。
生化危機3：滅絕
「拉昆市核爆案」（病毒洩漏）的三年以後，昔日地球已面目全非，『T病毒』毀滅拉昆市之後在幾個月內橫掃了全球，地球上的大部分靠近沙漠的城市已再度被沙漠吞噬，而森林與河流也全部燒毀和乾涸。地球大部分人口變成感染者，但也有一小部分人口組織起來繼續在地球上生存，而製造病毒的罪魁禍首『保護傘公司』雖然全面崩盤，但公司在地底下建立的核心基地仍然繼續運作，公司面對這場病毒危機也在繼續他們的病毒實驗，而公司卻企圖利用感染者進行馴化，即將創造一個感染者的世界。
生化危機4：戰神再生
延續第三集的劇情，時間來到T病毒爆發的四年後。本來由保護傘公司研製出來對抗神經性疾病與延遲衰老的病毒，卻發現它的副作用會造成復活人類的死亡細胞並將它的宿主變成嗜殺成性的喪屍。此病毒席捲全球後，不斷進化的喪屍狩獵著為數不多的倖存者，將地球轉變成一個恐怖新世界。
生化危機5：懲罰
接續前作片尾的劇情，被保護傘公司所操控的吉兒·范倫廷帶領公司所有的特種部隊進攻了艾莉絲等人所在的「阿卡迪亞號」醫療船，並殺死了船上大部分的倖存者，艾莉絲雖全力反抗，卻遭一架墜毀的直升機撞擊船身後墜落大海.。
生化危機6：終章
故事敘述繼上一集《天譴日》（臺譯名）後，倖存者艾莉絲遭威斯卡背叛，與其他同伴失散。艾莉絲一醒來後，發現華盛頓已成荒蕪。後來艾莉絲在路上察覺自己正被攝影鏡頭監控著，而敏覺引領她走到一個地下室，登時打字機噠噠作響，「哈囉 艾莉絲」的字樣不斷從打字機釋出，接著螢幕倏忽亮起，紅後（Red Queen）現身並告訴艾莉絲在病毒爆發的地方「蜂巢」（Hive），藏有「保護傘公司」研製、靠空氣傳播的解藥，能殺死所有「T病毒」感染者，亦包括她自己。為了終結這一切，艾莉絲驅車前往拉昆市，萬惡的起源。