今天勺子接著介紹DNAMAN剩下的幾個常用內容
5．序列同源性分析
（1）兩序列同源性分析
通過Sequence/Two Sequence Alignment命令打開對話框
之後通常可選快速比對或最佳比對，當選擇快速比對時，設置較小的k-tuple值，可以提高精確度，當序列較長時，一般要設置較大的k-tuple值。（dna序列：k-tuple值可選範圍2-6；蛋白質序列：k-tuple值可選範圍1-3）
（2）多序列同源性分析
通過打開序列-多序列對比命令打開對話框
最終顯示如下圖：點擊「下一步」按鈕，並選擇其中一種方法。
如果在前一對話框選擇的是快速對齊,則在此對話框中選擇快速對準，否則選擇動態對齊即可。其它參數不必改變，點擊對話框中間的「默認參數」使其它參數取原始默認值。
點擊「下一步」按鈕，點擊左上角「選擇」按鈕，可以從彈出的對話框中選擇不同的結果顯示特性選項。點擊「選擇」按鈕下的「輸出」按鈕，之後可以通過這些選項，繪製同源關係圖、顯示蛋白質二級結構、繪製限制性酶切圖等。
6.PCR引物設計
首先，將目標DNA片段裝入通道,並激活通道。點擊主菜單欄中的引物主菜單，出現下拉菜單，如下所示：
其中包括下列選項：
擴增目的片段大小
正向引物選擇區
反向引物選擇區
Primer 引物特性 包括Length(引物長度)，Tm值,GC含量等參數；
Reject primer 引物過濾（將符合引物過濾條件的引物過濾掉）
之後按照需要的進行下一步即可完成操作。
7．畫質粒模式圖
我們常常要用到各種質粒圖，無論是製作幻燈片，還是發表文章，常常需要質粒圖。DNAMAN提供強大的繪質粒圖功能，能滿足我們的需要。通過繪製圖譜命令打開質粒繪圖界面：
將滑鼠移動到圓圈上，等滑鼠變形成「I」時，單擊滑鼠左鍵
最終出現以下菜單：
通過此對話框，你可以完成各種添加項目的操作，也可以修改已添加的項目。注意：
你可以通過滑鼠雙擊質粒圖上的項目來修改已添加的任何項目，可以通過滑鼠移動任何項目。你可以通過幫助文件獲取更多信息。
好啦，今天的分享就到這裡，希望這個軟體能在小夥伴的手裡發光發熱哦~