目前,色譜儀器在分析儀器中具有重要地位。由於色譜儀的色譜柱具有高效的分離能力，把物質按保留時間大小進行分離，然後通過與標樣保留時間進行對比的方法確定物質性質，因此對未知樣品很難定性分析。而質譜儀是直接測定物質的質量數與電荷的比值（m/z）在定性分析方面既準確又快速。把色譜與質譜聯合起來使用，氣相色譜質譜聯用儀型式試驗實際上是把質譜儀作為色譜儀的一個通用檢測器來使用。
質譜儀作為質量檢測器可以取代色譜儀的多種檢測器，通用性強，使用極其方便。而色譜儀有很多檢測器，如TCD、FID、ECD、FPD、NPD等，每種檢測器只有一定限度的適用範圍，不能通用，造成使用不便。所以說氣相色譜質譜聯用儀把色譜的高效分離作用與質譜計對未知樣品的準確鑑別能力相結合，把分析儀器提高到一個新水平，凡是能使用色譜儀的地方，均可以使用氣相色譜質聯用儀器。目前，色—質聯用儀器國際上公認在當前儀器分析中佔有非常突出的地位。氣相色譜質譜聯用儀是質譜技術、色譜技術與計算機技術三種現代化技術的結晶。由於技術難度大，我國一直不能生產，每臺平均售價60~100萬人民幣。據統計，2005年我國進口的各種色—質聯用儀約600臺。
國內有公司自行研製並開發成功了氣相色譜質譜聯用儀。這是我國第一臺商品化氣相色譜質譜聯用儀器，各項技術指標接近於當前國際先進技術水平。
氣相色譜質譜聯用儀應用範圍
1、應對各種突發事件，如有害物質洩漏、重大環境災害等
2、凡是需要氣相色譜儀進行檢測的場合，特別是對未知樣品進行定性分析的地方
3、反恐鬥爭、禁毒緝毒、爆炸物品分析等
氣相色譜質譜聯用儀基本工作原理
為了質譜儀器的正常工作，必須要組成高真空系統的真空室。儀器使用了高性能的渦輪分子泵與前級真空泵構成兩級真空機組以確保所需的真空。被分析樣品經毛細管柱分離，進入離子源。採用電子電力標準配置（EI），產生正離子，在推斥、聚焦、引出電極的作用下將正離子送入四極杆系統。四極杆在高頻電壓與正負電壓聯合作用下形成高頻電場，在掃描電壓作用下，只有符合四極場運動方程的離子才能通過四極杆對稱中心到達離子檢測器，再經離子流放大器放大，產生質譜信號。得到了質譜圖，通過解釋譜圖或進行譜庫檢索以識別未知樣品的組成。