真核生物的基因組DNA以染色質的形式存在。因此,研究蛋白質與DNA在染色質環境下的相互作用是闡明真核生物基因表達機制的基本途徑。染色質免疫沉澱技術(chromatin immunoprecipitation assay, CHIP )是目前唯一研究體內DNA與蛋白質相互作用的方法。
染色質免疫共沉澱(CHIP)的原理:
是在活細胞狀態下固定蛋白質-DNA複合物,並將其隨機切斷為一定長度範圍內的染色質小片段,然後通過免疫學方法沉澱此複合體,特異性地富集目的蛋白結合的DNA片段,通過對目的片段的純化與檢測,從而獲得蛋白質與DNA相互作用的信息。
染色質免疫共沉澱(CHIP)應用:
˙檢測體內反式因子與DNA的動態作用
˙研究組蛋白的各種共價修飾與基因表達的關係
˙CHIP與基因晶片相結合建立的CHIP-on-chip方法已廣泛用於特定反式因子靶細胞的高通量篩選
˙CHIP與體內足跡法相結合,用於尋找反式因子的體內結合位點
˙RNA-CHIP用於研究RNA在基因表達調控中的作用。
˙CHIPseq獲得全基因組範圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA區段信息
Diagenode Bioruptor非接觸式超聲波破碎儀以最全新的技術為CHIP的樣品處理保駕護航
˙寬廣的DNA超聲範圍,保證處理樣品的均勻一致
˙持續旋轉式樣本處理,保證絕佳的Chromatin Shearing 結果重複性
˙快速的超聲波破碎速度,縮短枯燥的等待時間
˙密閉式樣本處理,不產生感染性飛沫,確保操作人員安全
˙樣本完全不產生氣泡,保證了蛋白活性
˙一次樣品最大處理量可達12支,提高實驗的速率
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