課程免費領取 | 微生太擴增子分析第一節：α多樣性分析及繪圖

2020-09-12 SCI分析師

擴增子測序是一種二代靶向測序技術，它使用PCR技術來生成稱為擴增子的DNA序列，它簡單、快速、應用廣泛。擴增子測序可以有效地識別微生物高可變區並有效獲取微生物物種的信息。

擴增子測序主要包括16S rDNA測序、18S rDNA測序、ITS測序及目標區域擴增子測序等。16S rDNA是細菌分類學研究中最常用分類的marker基因信息，其序列包含9個可變區（Variable region）和10個保守區（constant region）。可變區因細菌而異，且變異程度與細菌的系統發育密切相關。通過檢測16S rDNA的序列變異和豐度，可以了解環境樣品中群落多樣性信息。基於16S rDNA的分析在微生物分類鑑定、微生態研究等方面起到重要作用，目前是研究海洋、土壤、腸道糞便等環境中的微生物群落構一種重要普遍的研究方法。

針對擴增子測序的統計分析流程，我們製作了8節免費系列分析課程來對擴增子分析進行介紹。


1. α多樣性分析及繪圖(添加顯著性標記的箱線圖)，

2. β多樣分析及繪圖（PCoA，NMDS），

3. 相關性分析及繪圖（添加顯著性標記的熱圖），

4. 論文圖片的編輯和排版，

5. 微生太16S分析結果文件夾及結題報告的解讀，

6. 使用LEFSE尋找在組間有差異的特徵微生物，

7. R語言Venn圖分析組間特有和共有的物種，

8. QIIME2+Galaxy PICRUSt進行16S功能預測。


為了回饋關注微科享的粉絲們，本次分享免費第一場， α多樣性分析及繪圖(添加顯著性標記的箱線圖)。



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