廣東海洋大學，位於廣東省湛江市。是廣東省重點大學，省部共建高校。學校的前身是創建於1935年的廣東省立高級水產職業學校。1997年湛江水產學院和湛江農業專科學校合併組建湛江海洋大學。2001年湛江氣象學校併入。2005年更名為廣東海洋大學。
南方醫科大學，位於廣東省廣州市。廣東省屬重點大學。學校前身是創建於1951年的中國人民解放軍東北軍區軍醫學校。學校1979年被確定為全國重點大學。2004年8月由軍隊整體移交廣東省，更名為南方醫科大學。
南方醫科大學出生於東北，而且也長在東北，後來因為中俄關係經過兩次搬遷來到廣州市，雖然因搬遷實力有所損傷，但是實力依舊在。南方醫科大學建校之初的班底實力遠高於廣東海洋大學，而且南方醫科大學一直屬於軍隊序列，04年才歸到地方，曾經也是不差錢的主，發展速度也是十分驚人，廣東海洋大學無論是基礎實力，還是發展速度都要落後於南方醫科大學，所以兩校實力差距還是非常大的。
根據教育部近期學科評估來看，南方醫科大學7個B類學科，2個C類學科，最高評級為B+級，基礎醫學、公共衛生與預防醫學、中西醫結合；廣東海洋大學有2個B類學科，1個C類學科，其中最高評級為B-級的食品科學與工程、水產。由此可見，兩校的學科建設差距真是不可同日而語。
綜合來看，南方醫科大學的實力完爆廣東海洋大學。