南方醫科大學前身為中國人民解放軍第一軍醫大學，創建於1951年， 1979年被確定為全國重點大學，2004年被批准為全國8所試辦八年制醫學教育的高等院校之一，2004年8月按照國務院、中央軍委下達的命令，整體移交廣東省，更名為南方醫科大學。現有校本部、順德校區2個校區，佔地面積176.68萬平方米，建築面積84.67萬平方米。面向全國31個省、自治區、直轄市及港澳地區招生。
辦學規模: 現有第一臨床醫學院、第二臨床醫學院、基礎醫學院、中醫藥學院、護理學院、生物技術學院、藥學院、公共衛生與熱帶醫學學院、生物醫學工程學院、人文與管理學院、外國語學院、研究生(論壇) 學院、繼續教育學院、醫學職業技術學院、國際教育學院、馬克思主義學院等16個學院，擁有6所直屬附屬醫院（南方醫院、珠江醫院、第三附屬醫院、江都醫院、中西醫結合醫院、北滘醫院），開設了26個本科專業，其中6個國家特色專業，6個廣東省名牌專業。現有全日制在校生15514人，其中本專科生12061人、研究生3027人、留學生501人。
學科建設: 學科覆蓋醫學、理學、工學、文學、管理學、法學、經濟學等7大學科門類。現有6個博士學位授權一級學科（臨床醫學、基礎醫學、公共衛生與預防醫學、中西醫結合、中藥學、生物醫學工程），7個博士後科研流動站（基礎醫學、臨床醫學、生物醫學工程、公共衛生與預防醫學、生物學、中西醫結合和藥學），53個博士學位授權點，65個碩士學位授權點。擁有3個國家重點學科（人體解剖與組織胚胎學、內科學（消化系病）、中西醫結合臨床），2個國家重點培育學科（病理學與病理生理學 外科學（骨外）），5個國家中醫藥重點學科（中醫內科腎病學、中藥製劑學、中醫內科腦病學、中藥藥理學，中醫痺病學）。擁有10個廣東省重點學科，1個教育部工程研究中心，1個教育部工程技術中心建設項目，2個省部共建重點實驗室，13個廣東省重點實驗室，4個廣東省教育廳重點實驗室。國家重點學科分別布局在3個一級學科，省級重點學科覆蓋24個二、三級學科。
人才隊伍: 現有專業技術人員6079人，其中高級專業技術職稱1100人。擁有院士3名，雙聘院士2名，「973」項目首席科學家2名，國家教學名師2名，全國模範教師和全國優秀教師5人，全國高校骨幹教師7人，廣東省教學名師6人，「長江學者」4人，國家傑出青年基金獲得者5人，「何梁何利獎」獲得者3人，「新世紀百千萬人才工程」國家級人選6人，國家級教學團隊2個，博士生導師236名、碩士生導師639名，先後有133人享受國務院特殊津貼。
教學改革: 「十五」以來，先後承擔了包括國家「十五」、「十一五」教育科學規劃項目和「世行貸款」項目在內的國家、軍隊和廣東省教育研究課題93項。在多科性醫科大學辦學模式、實驗教學改革、創新教育、教學質量保障、教學管理信息化建設、醫學教育技術研究、科研促進教學、醫學人文教育等方面進行了深入探索和改革實踐。獲得省部級以上優秀教學成果獎49項，研製的《醫學通用題庫》，獲得軍隊優秀教學成果二等獎，在全國50多家院校推廣使用。開發的教務管理軟體《軍隊院校學籍管理系統》，被指定為全軍和武警院校的教務管理系統。73項省部級二等獎以上科研成果（佔「十五」以來總成果的58.87%）已經轉化為教學資源直接服務本科教學；主編出版「十一五」規劃等高水平教材11部，58項多媒體教材獲省部級以上成果獎；目前建有6門國家精品課程、19門廣東省精品課程、2個國家實驗教學中心、9個廣東省實驗教學示範中心；建設了44門PBL課程、54門雙語課程、33個本科生創新教育基地。改革成果在眾多高水平學術刊物發表，被《人民日報》、《光明日報》、《解放軍報》、中央電視臺、《中國教育報》、《中國青年報》、鳳凰衛視等主流媒體多次報導。
科學研究: 「十五」以來，先後承擔各類課題2139項，獲得縱向課題經費5.13億元，主持「973」課題3項、國家自然科學基金重點項目12項；作為第一完成單位獲國家技術發明二等獎1項，國家科技進步二等獎7項，省部級科技成果一等獎24項。2000年以來，我校有5項科研成果7次入選國家公布的年度科技十大新聞。2004年~2008年，國家科技部公布的Medcine 收錄論文排名中，我校連續5年在全國1000餘所高校中位居前16名；2006年，侯凡凡教授的原創論文在國際頂尖醫學雜誌《N Engl J Med》（《新英格蘭醫學雜誌》）上發表,影響因子51.296，該成果被美國內科學年報評為「2006年內科學領域最重要的14項研究進展之一」。
醫療實力: 擁有6個廣東省醫學重點專科， 廣東省35項 「名醫工程項目」我校佔9項。有直屬附屬醫院6所（南方醫院、珠江醫院、第三附屬醫院、江都醫院、中西醫結合醫院和北滘醫院），其中第一臨床醫學院（南方醫院）、第二臨床醫學院（珠江醫院）都是高水平綜合性教學醫院，展開床位5000餘張。在消化病診治、腎病的綜合治療、中西醫結合診療、腎肝移植、異體手移植、造血幹細胞移植、心腦血管介入、創傷修復、新生兒重症救治和圍產醫學等方面形成了明顯的特色優勢。南方醫院惠僑科被中央軍委授予「模範醫療惠僑科」榮譽稱號，並得到江澤民同志親筆題詞嘉勉。
產業開發: 自20世紀80年代以來，學校堅持以「科學技術是第一生產力」為指導思想，開創了全國高校產學研一體化先河，以自主研發的「三九胃泰」、「正天丸」、「無限極口服液」、 「尿毒清」等產品為基礎，先後創建了深圳南方製藥廠（三九集團前身）、南方李錦記營養保健品有限公司（現名無限極（中國）有限公司）、廣州康臣藥業有限公司等國際知名的醫藥企業。2004年轉制地方以來，取得科技成果300餘項，研製出國際上第一個SARS抗原檢測試劑盒、國家1類新藥全氟丙烷人血白蛋白微球注射劑、f-PAX系統等重量級的科研產品並成功轉化，在生物醫藥、保健食品、醫療器械、日用化工等多個醫藥相關領域新建立了東方藥林、南方潔靈、宜誠數字醫療等一批高新技術企業。