ESI，全稱是基本科學指標資料庫，是一種基於科研論文的評價工具，目前已經被世界各國普遍使用，並且已經成為評價高校科研水平和學科實力的重要標準。清華大學、浙江大學都是我國的頂尖985大學，這兩所大學在ESI上的表現也一直都受到大家的廣泛關注。在大家的印象當中，清華大學、北京大學是我國最好的兩所大學，而浙江大學似乎要低一個檔次，所以，很多人會認為，清華大學在ESI上的所有指標都會高於浙江大學，其實並不是這樣。
高校的某個學科進入ESI全球前百分之一，一般會認為，高校的這個學科已經達到世界先進水平，而這幾年清華大學的ESI全球前百分之一學科數量一直都比較少。2015年9月的ESI數據，清華大學的ESI前百分之一學科數只有14個，而浙江大學有18個，上海交通大學和復旦大學都有16個，南京大學也有15個。2016年9月的ESI數據，清華大學ESI前百分之一學科數上升到16個，而浙江大學、上海交通大學、復旦大學、南京大學分別達到18個、17個、17個、16個。2017年11月的ESI數據，清華大學的ESI前百分之一學科數達到17個，終於超過南京大學，並與上海交通大學、復旦大學持平，但還是比浙江大學少一個。
但是，在最近公布的2018年5月的ESI數據中，清華大學一下子新增兩個ESI前百分之一學科，總數達到19個，終於超過了浙江大學。清華大學新增這兩個ESI前百分之一學科是很不容易的，為什麼這麼說呢？因為清華大學新增的這兩個學科分別是免疫學、神經科學與行為科學，這兩個學科都屬於醫學，而清華大學長期以來是沒有醫學院的，2001年清華大學才成立了自己的醫學院，到現在還不到二十年的歷史。其實，浙江大學的發展要比清華大學幸運的多。
2006年左右，清華大學曾經想合併著名的北京協和醫學院，但並沒有成功，現在北京協和醫學院雖然掛著「清華大學醫學部」的牌子，但還是獨立存在的。另外，清華大學、浙江大學的農學院都曾經被分出，但後來浙江大學重新合併了由自己農學院發展而成的浙江農業大學，而清華大學卻沒有找回自己的農學院，所以，清華大學在學科設置上要比浙江大學少一個農學學科。另外，除了計算機科學與技術、材料科學與工程外，所有的工學學科在ESI中都屬於工程學這一個學科，所以在比較ESI前百分之一學科數量時，清華大學是不佔優勢的，因為清華大學的優勢學科基本上都集中在工學學科上面。
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