頭孢類藥物和阿奇黴素都屬於消炎藥，準確而言，屬於抗生素，說白了，就是協助人體消滅細菌類微生物的，頭孢類藥物屬於β-內醯胺類抗菌藥物，而阿奇黴素屬於大環內酯類抗菌藥物。兩者同是抗細菌藥物，但兩者又有著各自的特點，具體區別有以下三點：
1.二者對付的細菌類別不同
常用頭孢類藥物有四代，一、二代頭孢類藥物主要用於抗革蘭氏陽性球菌，如我們身體表明的細菌葡萄球菌。第三代頭孢類藥物為廣譜抗菌藥物，雖然對葡萄球菌類似的革蘭氏陽性菌抗菌作用不及一、二代頭孢類藥物，但對類似腸道細菌的革蘭氏陰性菌及厭氧菌都有較強的抗菌作用。第四代頭孢類藥物抗菌譜更廣、抗菌活性更強、穩定性更好，常規不使用，可用於對第三代頭孢類藥物耐藥的細菌。
阿奇黴素是抗菌譜更加廣泛，不僅包含革蘭氏陽性細菌、革蘭氏陰性細菌、厭氧球菌，還包括肺炎支原體、衣原體、立克次體和螺旋桿菌等。
2.作用機制上不同
頭孢類藥物主要是通過抑制細菌細胞壁合成，讓菌體失去保護屏障而膨脹、裂解，同時藉助細菌的自溶酶，溶解菌體從而產抗菌作用，屬於殺菌藥物。阿奇黴素主要通過與細菌核糖體50S亞基的靶位不可逆結合，14元大環內酯阻斷肽醯基t-RNA移位，16元大環內酯抑制肽醯基的轉移反應，選擇性抑制細菌蛋白質的合成，而起到抗菌作用，屬於抑菌藥物，高濃度時也有殺菌作用。
3.用藥時間不同
在用藥時間上：大多數頭孢類藥物半衰期短需要一天兩次或三次給藥。而阿奇黴素半衰期為35-48小時，一天用藥一次即可，根據不同病情給藥周期、方案也有不同，需要在醫師或藥師指導下用藥。
總之，對於一般的細菌感染，如果不是頭孢過敏，首選是頭孢，因為頭孢類殺菌效果好，但如果是支原體等病原體感染，則只能選擇阿奇黴素。有些特殊情況下，二者可能聯合起來對付複雜的細菌感染。