現如今，人們對水體中的投入品越來越謹慎。其實水體中的許多病害不一定非要用藥解決，可以採取一些生物的方法予以防治。在養殖過程中，可以巧妙地利用各種魚類的生活習性之間的互補性，適當套養一部分魚類，達到調節水質、防治病害、以魚養水、以魚養魚的目的。
一、套養鯉魚、鯽魚。鯉魚、鯽魚是水底名副其實的「清潔工」，它們生活在水體底層，攝食水底的殘餌和腐殖質。在養殖水體中適當套養部分鯉魚、鯽魚，可充分利用水體中殘餘的有機物，大大減少水體底部有機物的腐化分解，減少魚病發生的機率。
二、套養青魚。利用青魚可以抑制水體中的螺螄等生物。青魚常常棲息於水體的下層，肉食性，多攝食昆蟲幼體、螺蜆、幼蚌類等。在水體中套養青魚，一方面可以抑制螺螄生長確保有一個良好的水體環境；另一方面，可以促進青魚的生長，增加水體的產出和效益。
三、套養鰱魚。鰱魚可稱為水體的「過濾器」，它是濾食性魚類，以浮遊植物為食，在水體中適當套養鰱魚可以充分利用水體中的浮遊生物等天然餌料資源，控制水體肥度，從而達到調節水質的作用。同時，鰱魚還是水體中缺氧泛塘的的「預報員」，當水體中鰱魚出現浮頭時則說明水體中已開始缺氧，有泛塘的危險，必須立即採取增氧措施。
四、套養鱅魚。利用鱅魚可以抑制水體中的輪蟲。鱅魚生活於水的中上層，動作較遲緩，不喜跳躍，主要以浮遊動物為食，亦食部分浮遊植物。水體中如輪蟲等較多，影響水體環境，可套養部分鱅魚予以控制。
五、套養草、鯿、魴魚。草、鯿、魴魚這三種魚被稱為水體中的「衛生員」，在水體中水生植物過多，或岸邊草類很多的情況下，為了減少水體中氧的消耗和防止養殖環境的破壞，可適當套養一些草魚、鯿魚或團頭魴等，既可以保證水體溶氧充足，淨化養殖環境，又可以利用天然餌料增加水體的產出量。在水體中，草魚生活於水的中下層，以水草為主要餌料，亦攝食其它旱生嫩草枝葉，團頭魴還吃草魚吃剩的碎草屑，鯿魚還喜食水中的藻類。
六、套養鱖魚、烏鱧、鱸魚等。鱖魚、烏鱧、鱸魚算得上是水體的「除雜先鋒」，它們性情兇猛，能大量攝食水中的野雜魚、小蝦等，適當套養三者中之一，可以有效控制水體中野雜魚蝦的生長繁殖，減少與主養魚爭食爭氧的競爭壓力，還可以利用天然動物餌料增加水體產量和效益。象鱖魚、烏鱧等主要採食水體中的鮮活魚蝦，而加州鱸、鯰魚等還食水中死亡的動物的屍體以及內臟，它們都是清除水體汙染的好幫手。
七、套養紅色魚類。像紅鯉魚、紅鯽魚、紅羅非魚等常當作養殖中的「指標魚」，通過這些紅色魚的生長及生活情況，可以了解水體中的營養狀況及魚類體重生長情況。在網箱養殖中，如果想檢查網箱是否破損，可以放養數十尾紅色魚，若此類魚大量減少，說明網箱有破損的可能，須採取措施解決，以減少不必要的損失。另外，這些魚類以其鮮豔的體色和快捷的遊泳速度，可以有效防止水老鼠、水獺等偷食魚類。
八、套養黃顙魚。利用黃顙魚可以抑制水體中的錨頭鰠。黃顙魚幼魚時期以枝角類、橈足類為食，成魚以小蝦、小魚為食，亦食其它魚的卵，尤其是對水體中的錨頭鰠等有抑制作用，它可直接攝食錨頭鰠，也在啃食其它魚類身上的錨頭鰠等。
九、套養羅非魚。羅非魚是熱帶魚，雜食性，在水體中的作用較大，它既食水生植物，又食各種有機碎屑、藻類和水生昆蟲，既充分利用了水體資源，又可調節水質。羅非魚常在水底挖巢，不斷拱起底泥，可促進水底有機質分解，改良水質。同時，羅非魚喜食水中的魚蝨、錨頭鰠等，能減少魚病危害。