文章來源：解螺旋 (ID:HelixLife)
GraphPad Prism是一款高效易用的科研繪圖工具，集生物統計、曲線擬合和科技繪圖於一體，還可用於 Windows 和 Mac 作業系統，在生物學以及社會和物理科學界得到廣泛使用。
事物都在不斷發展與進步， 2020 年 10 月 30 日，Graphpad 公司隆重推出了 Graphpad Prism 的全新版本 Graphpad Prism 9（以下簡稱 Prism 9）！
總的來說，Prism 9 與 Prism 8 很相似，很容易上手，所以廣大熟練使用 Prism 8 的用戶可以無縫對接到 Prism 9。
相同點無需贅述，那麼作為最新版本的 Prism 9 新在哪裡？接下來就讓我們一起來圍觀 Prism 9 的新功能吧！
一、更加智能，自動添加多結果統計學差異
在某科研論壇上有一個問題，橫線表示 p 值，可以在 prism 軟體中畫出，那每根柱子上面的線表示什麼意思，怎麼用 Prism 畫出來？
在 Prism 9 中只需滑鼠單擊一次即可自動連線並將統計結果添加到圖形中，工作效率得到極大的提高：
使用步驟：
1.打開 Prism 9，New table ＆ graph 選擇 Column，輸入示例數據：
2.Graphs 下選擇柱形圖加散點，得到基本圖形如下：
3.點擊 Analyze，對兩組數據進行相應的統計學分析，此處進行 t 檢驗，點擊 OK 完成統計：
4.點擊 Draw 下帶紅色星號（*）的劃線工具，即可自動添加連線與統計差異：
雙擊該工具可以對顯示的顏色等信息進行設置，例如 Display options 可以設置顯示具體的 p 值或星號，Line/bracket and text options 可以設置組間連線的粗細及顏色等。此外對存在顯著性差異的 p 值閾值進行設置 ——P value threshold：
單因素方差分析的自動標記方法與前述類似：
有一個小問題，如果我不想顯示沒有差異的比較該怎麼辦？
那麼請雙擊自動劃線工具，點擊 Comparisons on graph，不勾選不想顯示的比較兩組，即可去除畫線與 ns：
二、新的圖形，氣泡圖和評估圖
氣泡圖（bubble plot）：可顯示多元變量數據，可清晰的呈現多個數據之間的關係。例如，下圖顯示了 X、Y, 氣泡大小與顏色多元變量之間的關係：
基本步驟為：
1.打開 Prism 9，New table ＆ graph 選擇 Multiple variables，輸入數據：
2.在 Create New Graph 下的 Kind of show 選擇 Bubble Plot，分別選擇 X 軸、Y 軸、氣泡大小與顏色對應的變量，點擊 OK 即可得到氣泡圖，後續進行美化與調整：
3.雙擊氣泡進入 Format Graph, Fill Color 中 Prism 9 提供了多種配色方案：Plasma、Viridis、Magma 等。
從 t 檢驗生成評估圖（estimation plot）：該圖形左側散點顯示了 Male 與 Female 的原始數據，右側顯示了效應量（平均數差值）及其 95% 置信區間的大小。
如下圖所示：如果效應量 95% Cl 包括 0 則 p>0.05，如 95% Cl 不包括 0，則 p<0.05。需要引起注意的是，目前從 t 檢驗生成評估圖只適用於 t 檢驗（非配對 t 檢驗和配對 t 檢驗）。
基本步驟為：
1.打開 Prism 9，輸入數據得到圖形後，點擊 Analyze 進行統計學分析，進行 t 檢驗：
2.t 檢驗時進行參數設置，Graphing options 處就可以設置是否顯示 95% 置信區間與效應量：
非線性回歸的實際與預測圖。殘差圖是指以某種殘差為縱坐標，以其他適宜的量為橫坐標的散點圖，殘差圖是進行模型診斷的重要工具。非線性回歸的實際與預測圖可以創建五個殘差圖（包括新的實際與預測圖），在 Prism 8 中只能得到一個圖。五種殘差圖如下：
三、新的分析，主成分分析（PCA）和主成分回歸（PCR）
PCA 是一種用於分析多變量數據的方法，可將多個指標化為少數幾個綜合指標的一種統計分析方法，即通過降維技術把多個變量化為少數幾個主成分的方法。
Prism 9 PCA 提供的其他功能包括：
1. 通過平行分析選擇成分（以及 Kaiser 方法、總方差閾值法等）；
2. 生成 Scree 圖、Score 圖和 biplot 圖；
3. 自動準備 PCA 結果，以便進一步用於多元線性回歸。
四、更高的數據維度
除上述更新外，Prism 9 為適應大數據集的分析要求進行了一系列更新，主要涉及將數據列的上限提高至 1024 列，可自動識別變量類型，數據表可輸入文本信息與自動變量編碼等。
https://www.graphpad.com/guides/prism/latest/user-guide/new-organization.htm！
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