美國已發布2.1版本的IMG數據管理系統

2021-01-11 生物谷

    美國能源部Joint基因組研究所（Joint Genome Institute ，DOE JGI）向公眾開放了2.1版本的IMG（Integrated Microbial Genomes，綜合微生物基因組）數據管理系統。 

    IMG 2.1的內容全部更新，並根據最新版本的NCBI參考序列庫（Reference Sequence，RefSeq）提供的基因組信息增加新的數據。 

    IMG 2.1共包含2,782種新的基因組（細菌61種、archaea 34種、真核基因組24種、噬菌體1661種及質體402種）。在這些基因組中，2,524種已經完成測序，且258種為草圖。IMG 2.1中108種已經完成定序及94種草圖的基因組是由DOE JGI所定序的。 

    IMG 2.1以基因為基礎向外延伸，與NCBI的Entrez Gene以及其它微生物基因組系統，如勞倫斯伯克力美國國家實驗室的微生物在線（MicrobesOnline）、Argonne國家實驗室的PUMA等建立了廣泛聯繫。 

    IGM的網址為http://img.jgi.doe.gov/，是由DOE JGI和勞倫斯伯克力美國國家實驗室

    Biological Data Management and Technology Center (BDMTC)聯合主辦的。IGM每季升級一次。
 
    DOE Joint Genome Institute受到DOE科學辦公室資助，結合了勞倫斯伯克力實驗室、勞倫斯立物莫實驗室、Los Alamos實驗室、Oak Ridge實驗室和西北太平洋實驗室這五個國家實驗室的技術，與史丹福大學的人類基因組中心連手進行基因組研究。  

     (資料來源 : Bio.com)

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