這三所高校都是世界一流大學建設高校，而且在化學學科領域內的實力相當，無論選擇哪一所大學，未來都會有很好的發展潛力。但我們選擇大學不但要考慮學科實力，高校的地理位置等因素也是我們要考慮的方面。
中國科學技術大學、南京大學以及南開大學都是我國985工程重點大學，在諸多學科領域內有著強勁的實力。在化學學科領域內，這三所高校的表現也都非常的突出，目前三所高校均為世界一流大學A類建設高校，一流學科中均有化學專業。
在全國高校第四輪學科評估中，中國科學技術大學的化學學科獲得「A+」檔學科評估結果，是本學科領域內成績最好的三所大學之一（另外兩所是清華大學和北京大學），南開大學的化學學科也獲得了A檔學科評估結果，南京大學則獲得了「A-」檔學科評估結果。
三所高校的基本情況和學科實力如何？
剛剛也給大家說了，中國科學技術大學、南京大學和南開大學都是我國高校中非常有實力的好大學，但是三所高校的整體情況和優勢學科，還是有所區別的，筆者在此建議，大家在這三所高校之間選擇時，可以將這些方面作為參考依據。
首先來看中國科學技術大學，中國科學技術大學是中科院下屬的一所大學，是以前沿科學和高新技術為優勢特長，可能很多人都以為中國科學院大學與中國科學院有著最直接的關係，其實中國科學技術大學也是如此。中國科學技術大學除了985工程院校的身份，還有一個非常響亮的身份——中國C9高校成員（頂尖大學聯盟成員）。
目前中國科學技術大學是我國世界一流大學A類建設高校，共有11個一流學科，化學學科位列其中。
再來看南京大學，南京大學同樣是我國頂尖大學聯盟成員高校，我國最早的重點大學之一。大家都知道，現在很多985院校都是由好幾所大學合併而來，而南京大學卻是一所拆分了很多大學之後依然保持頂尖實力的大學，值得一提的是，有些拆分出去的大學，現在也變成了985或者211院校。
南京大學同樣是一所世界一流大學A類建設高校，其共有15個學科入選一流學科，其中就包括化學學科。
最後來和大家說一下南開大學，南開大學曾經與北京大學、清華大學共同組成西南聯合大學，並被大家稱之為「學府北辰」。現在的南開大學是我國世界一流大學A類建設高校，共有5個一流學科，包括世界史、數學、化學、統計學、材料科學與工程 ，可以看得出，化學學科也是其一。
三所高校的地理位置等其他因素。
擇校選專業從來都不是一件簡單是事情，我們需要考慮的因素眾多，除了高校的學科實力，中國科學技術大學、南京大學和南開大學的地理位置也是我們要考慮的因素之一。中國科學技術大學目前位於安徽省，是整個安徽地區實力最強的大學；南京大學位於江蘇南京，也是江蘇省最有實力的一所大學；南開大學則位於天津市。整體而言，南京市和天津市的地理位置更好一些，而中國科學技術大學在化學學科上更有優勢一些。
一直以來，筆者的建議都是將高校的學科實力、地理位置以及個人的喜好等多方面因素考慮在內，權衡利弊之後做出選擇。無論我們選擇哪所高校，這三所高校都是我國實力非常強勁的好學校，大家能夠考上，就已經非常了不起。