編碼以五級編碼設置，用十二位阿拉伯數字表示。一、二、三、四級編碼統一；第五級編碼由工程量清單編制人區分具體工程的清單項目特徵而分別編碼。
各級編碼代表的含義是：
①第一級表示分類碼(分二位，按建設工程工程量清單計價規範 GB 50500-2008附錄順序確定)；
附錄A 建築工程為01，附錄B裝飾裝修工程為02，附錄C安裝工程為03，附錄D市政工程為04，附錄E園林綠化工程為05；
②第二級表示章（專業工程）順序碼(分二位)；
③第三級表示節（分部工程）順序碼(分二位)；
④第四級表示清單項目（分項工程）名稱碼(分三位)；
⑤第五級表示擬建工程量清單項目順序碼（三位），由編制人依據項目特徵的區別，從001開始。
分部分項工程量清單的項目編碼，按5級設置，用12位阿拉伯數字表示。其中，1~9位為統一編碼：
1、2位為附錄順序碼（例如：建築工程01，裝飾裝修工程02，安裝工程03，市政工程04，園林綠化工程05）；
3、4位為專業工程順序碼；
5、6位為分部工程順序碼；
7~9位為分項工程項目名稱順序碼；
10~12位清單項目名稱順序碼。
典型題目：01 03 02 001 001
第1級附錄順序碼，1、2位01—附錄A建築工程；
第2級專業工程順序碼，3、4位03—附錄A第3章 砌築工程；
第3級分部工程順序碼， 5、6位02—砌築工程的第2節 磚砌體 ；
第4級分項工程項目名稱順序碼，7~9位001—磚砌體中的「實心磚牆」；
第5級清單項目順序碼，10~12位001～999—順序碼。
例如：
工程量清項目編碼
專業工程
章順序碼
分部工程
節順序碼
項目名稱
清單項目碼
清單項目編碼順序碼
0101
土石方工程
010101
土方工程
001平整場地
002挖土方
003挖基礎土方
004挖凍土方
005挖淤泥、流沙
006管溝土方
010102
石方工程
001預裂爆破
002石方開挖
003管溝開挖
010103土石方工程
001土石方回填
0102
樁與地基
基礎工程
010201
砼樁
001預製鋼筋砼樁
002接樁
003砼灌注樁
010202
其他樁
001砂石灌注樁
002灰土擠密樁
003旋噴樁
004粉噴樁
010203
地基與邊坡處理
001地下連續牆
002振衝灌注碎石
003地基強夯
004錨杆支護
005土釘支護
0103
砌築工程
010301磚基礎
001磚基礎
010302
磚砌體
001實心磚牆
002空鬥牆
003空花牆
004填充牆