所謂忍者的三四五九就是：三個等級，四項戒律，忍者五道，九字箴言。
三個等級
忍者之間也是有上下組織的，這點看過《火影忍者》的大家一定不會陌生。忍者之間分為上忍，又稱「智囊忍」，他們主要幹的是頭腦活，主要是運籌帷幄，策劃作戰，這些忍者並不一定要活動在暗處，所以有的又被稱為「陽忍」。其次是中忍，是在實戰中進行指揮的頭子忍者。最後是下忍，又稱為「體忍」，從字面上就能看出，作戰的執行者，在最前線戰鬥的忍者。
四項戒律
除了要燒腦賣力以外，據說忍者們還要恪守著四項戒律：不準濫用忍術（只能在公事上使用）、捨棄一切自尊（活著才有輸出）、必須守口如瓶（哪怕為此丟棄性命，是職業操守了）、絕對不能洩露身份（基本中的基本）。
忍者五道
此外，成為忍者的人肯定有著十分強大的意志，因為據說真正的忍者要通過食、香、藥、氣、體這五道來完成日常的修行和鍛鍊。
食，既是飲食。由於打探情報的時候經常要在屋頂、房梁或者樹枝之上，因此據說一名合格的忍者的體重是不可以超過60公斤的，因此他們經常要食用一些「低熱量、高營養」的食物，非常符合現代減肥美學。
香，就是指聞香識人。據說成功的忍者可以通過對方衣服上的氣味來判斷對方的經濟情況和社會地位，此外忍者還要在自己身上製造這些氣味，偽裝成其他身份的人，來掩蓋自己的身份。
藥，也就是說合格的忍者其實都是草藥專家。由於在執行任務的時候，總避不了受傷或者被蚊蟲叮咬什麼的，合格的忍者是會運用山林之中的各種草藥來應對這些情況。
氣，說的是練氣，這看起來非常的玄學。其實就是修身養性，保持冷靜。作戰的時候可以集中精力，出大事的時候不要一驚一乍。
體，很明顯，就是鍛鍊身體啦！
九字箴言
此外，雖然作品中的忍術都神通廣大，超出科學理解範圍，但實際上，真正的忍者其實還真的使用了些神神叨叨的玄學箴言來給自己打buff，這就是忍者的九字箴言。
這九字箴言大伙兒一定不會陌生，就是「臨、兵、鬥、者、皆、陣、列、在、前」。沒錯，這九個字就是從我們這兒傳過去的，而且流傳的時候還出現了個失誤，本來應該是「陣裂在前」的，卻變成了「陣列在前」流傳至今。