加州大學舊金山分校的科學家們發現，我們體內生活的細菌可以生產大量的藥用分子，為新藥開發提供了異常豐富的資源。這項研究發表在九月十一日的Cell雜誌上。
人體內共生的微生物能夠生產天然藥物，這些藥物對維持人體健康起到了重要的作用，文章的資深作者UCSF助理教授Michael Fischbach說。
「現在市面上的藥物都是製藥公司生產的，但我們現在知道，人體菌群也能生成同樣有效的藥物分子，」Fischbach說。
Fischbach介紹到，目前臨床上三分之一的藥物來自於微生物和植物，包括青黴素等抗生素、化療藥物和降膽固醇的藥物。人們不斷在土壤和海洋微生物中挖掘新藥，卻從未意識到我們自己就是一個「煉丹爐」。（延伸閱讀：PNAS：挖掘神秘基因簇的藥用價值）
人類微生物組計劃一直在研究常駐在人體各處的不同菌群，解析微生物多樣性和豐度與疾病之間的聯繫。實際上，這些細菌合成的小分子也很重要，它們控制著細菌和宿主之間的互作，只可惜這類研究還沒有跟上進度。
Fischbach等人開發了數據分析軟體ClusterFinder，依據土壤和海洋微生物的生物合成基因簇（BGC），系統分析了人類微生物組計劃的遺傳學資料庫。他們在人體不同位置的菌群中，鑑定了3,118個生物合成基因簇。這些基因簇編碼的酶，可以合成類似現有藥物的分子。
研究顯示，在人體菌群的基因組和宏基因組中，廣泛存在著編碼硫肽類抗生素（thiopeptide）的BGC。研究人員純化了共生菌Lactobacillus gasseri生產的硫肽，將其命名為lactocillin，並且解析了它的結構。他們發現，lactocillin的結構與一些已經通過臨床試驗的抗生素很相似，能殺死一些革蘭氏陽性致病菌，同時又無損於那些無害的細菌。宏轉錄組測序數據表明，lactocillin等硫肽BGC的確在體內得到了表達。
這項研究告訴我們，人類微生組中廣泛存在著編碼小分子的BGC。這些與人類共生的細菌，能在我們體內生產大量類似藥物的小分子。
「我們需要了解這些分子是什麼，有什麼功能，」Fischbach說。「這將為新藥開發提供的非常誘人的資源。」此外，人們也可以在此基礎上，從分子水平研究微生物組對人體的影響。
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