蒙古部發跡於斡難之時，本來是沒有文字的。
1204年，成吉思汗徵討乃蠻之時，乃蠻掌印官回鶻人塔塔統阿雖然遭逮捕，依然守著國家的印信。成吉思汗非常嘉許他忠於自己國家的行為，遂命令他掌管蒙古國的文書印信，並命令他教授太子、諸王畏兀字以書寫蒙古語，蒙古人至此時便採畏兀字以書寫蒙古語，學界稱為回鶻式蒙古文。
自元世祖委託國師八思巴另制八思巴字，每以「畏兀字」呼之，以示區別。但雖然禁令屢下，當時的蒙古人仍然喜歡使用回鶻式蒙古文，八思巴字遂轉以轉寫他族語音。直到明朝建立，元順帝北返，八思巴新字便罕見有人使用。嶺北等處諸蒙人仍以畏兀兒字體為正宗。
16世紀蒙古信奉佛教，廣譯遍傳佛經，蒙古文字因而普及、定型。因此16、17世紀之交，為蒙古之文藝復興。在這之前書寫蒙古語的之部分缺失，皆改進之。此時引入許多藏語、梵語之內典用語，取代以往蒙古人使用的辭彙。並且為了便於轉譯藏、梵語音，另造變體字母。字母之改良以阿里嘎裡為大宗。1587年，喀喇沁翻譯者阿尤希固什修改舊有的字體，自創了阿里嘎裡字體，這個字體可以表達所有的藏、梵語語音，且可以表達諸蒙古語所無之輔音群。此時部分古語遂棄而不用。學界謂此時之書面蒙文為古典蒙文。
清代，亦取鑑蒙古字體，創滿文以書滿語。二者字型相似，故能觸類旁通。此後自17世紀末至18世紀，古典蒙文得以充分發展。北京、內蒙古之木版印刷業俱盛，諳蒙語之帝王或者是藏族法師都參與編纂辭典、語法書等。
又1648年衛拉特蒙古和碩特部僧侶咱雅班第達亦改良傳統，分析蒙古文字的標音，造新體字「託忒文字」（todo mongγol），但此新字體只通行於天山南北路、伏爾加河諸處，東蒙古未有採用。
1686年，喀爾喀僧侶扎那巴扎爾（哲布尊丹巴）仿造藏文梵字，創造索永布字體，共有字母九十個，左起橫書，一樣能精確表達藏、梵語，以及蒙古語的語音。索永布字體非常的漂亮，寺院經常以此加以裝飾，只可惜此字體寫起來比八思巴字還不方便，因此罕用於社會上。同年扎那巴扎爾另造橫書方塊字，通行於喀爾喀各處之佛寺間。
20世紀初，曾有蒙古字拉丁化之議，當時卻未付諸實行。1946年以降，蒙古人民共和國由於蘇聯影響，改以西裡爾字母拼寫喀爾喀口語。現今在蒙古國已經恢復傳統蒙文，使用量較少。而中華人民共和國之內蒙古自治區則仍採傳統蒙古字。
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