相信大多數人都和我一樣，第一次接觸忍者就是從動漫「火影忍者」中看到的，那流暢有力的體術、眼花繚亂的忍術、精巧致命的忍具，無不使「火影忍者」在世界迅速走紅，給人們留下了極其深刻的印象，特別是「忍者」一詞。
近年來，由於忍者主題的動畫、漫畫和遊戲在全球範圍內走紅，全世界範圍內都出現了不同程度的「忍者熱」，這些都給人們塑造出一個較為固定的日本的忍者形象：忍者們從小接受特定的忍者訓練，進行十分刻苦的修行，練就出一身強大的本領，可以飛簷走壁，殺人於無形。非要形容的話日本忍者就跟國內武俠小說中那些修仙者類似，忍術也可以和武林秘笈相比。不同的是，國內的武俠客們總是以一種正面形象出現，都是一群自我意識很強的人，而日本的忍者們卻亦正亦邪，忍者以自己的使命和任務為主，忠於自己的團隊，忍者們常常要完全抹殺掉自我，全心全意對待眼前的任務，甚至不惜喪命，這種思想可以從日本的武士道文化中看出一點端倪。
一般人看來，日本忍者的一般形象都是一身黑衣，黑紗蒙面，可以熟練地使用飛廉、手裏劍等多種武器，他們會常人所不能的忍術，關鍵時刻可以釋放煙幕轉瞬消失，或者用樹葉變化出分身，迷惑敵人。此外，忍者身上往往還帶有兵糧丸、饑渴丸、水渴丸等神奇藥丸，關鍵時刻，只要小小一顆，就能解決人類的各種生理需求……
不過，根據吉丸教授的研究，歷史中真實的忍者可能遠沒有這麼神奇。歷史中的忍者最早可以追溯至江戶時代，他們大多出現在黑夜，為大名或封建貴族執行一些秘密的諜報任務。據考察，古代日本的忍者並不是一身黑衣蒙面，而是穿深藍色的或者深紅色的緊身衣，穿深藍色的或者深紅色的緊身衣在黑夜中活動更不容易被發現。
就和「火影忍者」中忍者制度所說的那樣，歷史中的忍者也有「上、中、下」三忍制度，各有各的職能而已，上忍又稱「智忍」，是忍者集團中最有智慧的人擔任，專門負責策略布局、戰術等的指揮工作，指揮底下的中忍和下忍去執行任務，；中忍才是實際行動的關鍵的人物，相當於小隊長，主要帶領下忍們應對任務中各種突發事件；下忍又名「體忍」，是忍者中的小兵，是在最前方最先與敵人直接交手的忍者。
日本的忍者忍術理論最初來源於中國的孫子兵法，日本人在孫子兵法的基礎上加上他們的伏擊之道和格鬥技巧就成了忍術，忍術裡不光是戰鬥技巧還有偽裝、隱藏、逃跑、爆破等技巧，大多忍者用的武器是忍刀和飛鏢等能隨身攜帶的小型武器，而且他們的武器大部分都可以一器多用，比如說：忍刀的刀鞘外都纏有繩子可以用於攀登。
而歷史上的著名忍者，莫過於服部半藏了，其實服部半藏並不是由於他有多厲害，而是歷史上他的卓越功勳造就了他的名譽。當時日本發生了本能寺之變，日本戰國時期的霸主織田信長死於本能寺。一石激起千層浪，各方競爭激烈，而此時的德川家康卻不在屬地，性命危在旦夕。此時的服部半藏凸顯了忍者的優勢，他立刻打探情況分析局勢，決定取捷徑護送德川回領地，這一路都是半藏先行探路，再護送家康通過，才免遭危難，使德川才能安全回到領地。最後幫助德川家康建立了日本歷史上著名的幕府統治。後來德川家康賜予服部半藏八千石的領地，他也率領伊賀忍者建立著名的忍者軍團，可以說服部半藏幫助了德川家康建立了霸業，也因為德川，服部半藏一下子成為忍者的代表人物。
所以，日本的忍者根本不像「火影」中那樣朝氣蓬勃，倘若非要那「火影」中的任務來比喻現實的話，那麼大概是「宇智波鼬」吧。（鼬尼桑最帥）