前言：
現在很多人都想了解清楚日本人起源到底在哪裡，真的是秦朝徐福帶去的遺民嗎？從現代的日本的基因圖譜留下的證據來看，日本人的血統很複雜，可以看出日本自古以來就是一個多民族的移民國家。那麼為什麼現代日本人都是大和民族呢？這就是今天要說的日本人的起源了。
起源一、從西伯利亞遷移的原始人
大約在公元前2500年，已經有來自西伯利亞的原始人從亞洲大陸穿越到日本北海道。從日本最早的人類遺蹟中，可以發現這是一個能夠生產石器但仍然靠狩獵和採集為生的鑽石社會。
這個原始社會因為陶器的繩索設計而被稱為【繩紋文化】，它與西伯利亞東部的考古發現有相似之處。據考古學家的DNA研究中，通過檢測非常大的樣本數量得出結論，認為現代日本人的繩紋血統僅為平均水平的3％，也就是說土著人的後裔數量在日本已經很少了。
北海道土著人對現在日本人文化的影響很小，甚至不存在。 因為日本人與其他現代東亞人在基因上有著密切的聯繫，並且明顯不同於北海道土著人。
起源二、從東南亞遷移的彌生人
在大約公元前250年，日本發現了另一個新石器時代的社區，它被稱為彌生文化，首先在東京的街道上被發現的他們最早的痕跡。這些人已經會種植水稻，因此被認為是從東南亞沿著琉球群島到達日本的。現在，日本人大多數的祖先是彌生人，是原始的日本人，他們將日本文化及其語言帶到了日本和琉球群島。
通過基因研究，我們知道現代日本人與當地的原始人中只有3％的DNA相似。而現代日本人與古代彌生人的DNA相似度高達80%，這種強大的遺傳差異意味著彌生島在很大程度上取代了當地的原始人。例如在北海道的日本原始人直到明治維新後才被完全併入日本，此後日本定居者(彌生人後代)對該島進行了殖民，並且人數迅速超過了當地原住民。
起源三、從中國與朝鮮半島移民過去的
大家知道，現在日本作為一個多血統人中融合的一個國家，卻只有一個民族：大和民族。在彌生時代，來自東亞的山東半島與朝鮮半島的人也移民到了日本，和當地的彌生人融合，形成大和民族。來自東亞的移民是長期性的，從春秋時代到三國時代，原因出乎一致：躲避戰亂與尋找生存空間。
從東北亞遷移到朝鮮半島之後，彌生族開始在日本定居並統治日本。首先是九州、四國和本州南部，最後迅速取代了人數眾多的土著部落，並開始擴大大和王國。從東北亞移民過去的人還向日本帶來了儒家文化，現代日本神道很大程度上是從儒家文化傳統演變而來的。日語是約公元800年前後從朝鮮半島到達日本的，彌生人在那裡創造了他們的文化，來自東北亞的移民為日本帶來了相似的語言生態和稻作農業。
結論：
如前所述，日本人的起源是多民族是眾所周知的，但是現在也無法知道彌生人的確切起源。有一些理論認為彌生人是從中國移民的，但彌生人又與朝鮮人、蒙古人、東南亞人等有聯繫。
目前普遍認為日本人起源於兩個地方，居住在日本北海道原住民：繩紋人，他們是靠狩獵採集者，是由不同的部落組成的。另外一個起源是東北亞經朝鮮半島、東南亞經琉球群島移居到日本的彌生人，他們帶來了稻作農業與儒家文化。這兩類人融合在一起，形成了一個新的種族：大和民族。