基於優秀的操作和戰鬥體驗、絕美的視聽效果、頗具新意的題材發揮等長處，《對馬島之魂》自然獲得普遍好評。相較於整體優異的遊戲性，其之於故事表現的評價似乎就沒那麼出眾。上市前評測不時散見「支線平淡」、「劇情簡單」等觀點，仿佛意味著本作故事普普通通、不值得玩家期待。
許多玩家親身實際體驗後就會發現：實情並非如此。《對馬島之魂》的主線劇情的確簡白單純，沒有什麼意圖出奇制勝的情節，但這之於一款遊戲而言卻並非壞事。《最後的生還者》（The Last of Us, 2013）的故事也是單純老套，而透過精彩的演出手法和引人投入的遊戲機制，仍使其成為電子遊戲敘事的典範。《塞爾達傳說：曠野之息》（ゼルダの伝説ブレスオブザワイルド, 2017）在簡單王道的日式奇幻框架下，同樣足以達成震撼人心的演出。我認為《對馬島之魂》踵繼前賢，也有達到逼近於此的效果。
至於說支線平淡則更是有待商榷。本作在支線設計上，極其用心地刻畫了一個個足以引人佇足沉思的故事，作為支線任務的鋪墊。那些情節沒有說教式的要求玩家反省道德或善惡之辯，但都成功使得支線本身更具深度和趣味性，也讓玩家從更多方面來認識這片土地上的種種民情風俗，經此更為加深身在其中的沉浸感。至少就支線的敘事價值上，《對馬島之魂》其實有著不亞於《荒野大鏢客II》（Red Dead Redemption 2, 2018）類此方面的表現。
特別在各個主要人物的連續性支線任務，更是各有各自的精彩、幽默、詭譎、哀傷或激昂之處，也讓玩家能夠更加理解這些並肩作戰的盟友，而不是只當作功能性的NPC而已。結奈、堅二、石川師傅、政子夫人、典雄、百合子……，他們不僅性格特徵鮮明，通過一次次的共同行動，玩家還能發現其各自複雜多樣的人格，而非僅止於單一屬性的角色樣板。這些生動活現的人性特質，都足以令玩家感到故事真實可信，使自身更加投入其中，從而為種種情節感動、激蕩、低回再三，或什至震驚膽寒。
在塑造人物和情節推演上，SP社已然透過大量的對話文本和互動，來豐富故事的細節、講究人物心理活動變化的合理性。有時候玩家乍看之下以為突兀的情節發展，其實往往都在之前的故事中充分布局，有賴玩家細心品味。
作為一款開放世界動作遊戲，《對馬島之魂》表面上看起來雖然並非是以劇情為作品的核心驅動力，但其實它的故事和演出，都已經達到相當高的標準。包括作為主角坐騎的馬匹，與之相關的情節也足以牽動玩家的情緒。說《對馬島之魂》的劇情設計為其弱項，並不是公正客觀的觀點。相反地，正因為本作中連一般平民百姓有關的故事也具備亮點和戲劇性，才使得眾多玩家遲遲難以推進主線劇情，而沉浸在支線任務的遊歷之中。（再……再爬一座神社就好……）
（以下有重大劇透，請尚未攻略金田城、進入第二幕的玩家迴避）
我想以龍三的轉變為例，試圖分析SP社在對馬故事中的人物塑造和行為動機處理上，講究細節的獨到用心。
某天夜裡，我的一位朋友在通過金田城、順利推進到第二幕之後，跟我抱怨有關於龍三背叛的橋段似乎缺乏鋪陳，故事之所以這樣設計好像只是為了爆點而設，沒什麼說服力。
我的看法正好相反。龍三的行動分明完全合情合理，不只基於戲劇性的張力處理，而且是「意料之外，情理之中」、符合性格和動機的安排。光只就遊戲歷程中所透露的資訊，龍三至少就有四個理由轉做「日奸」、成為蒙古人的走狗。這些理由可以對應到龍三的四種不同身份，分別是：「鬥笠幫新任幫主」、「浪人」、「劍客」，以及「仁的童年好友」。
首先是作為鬥笠幫的新任幫主。龍三顯然責任感強烈，在和他一起進行的任務劇情中，其不時就會提到要為幫裡兄弟們尋找穩定的糧食來源。他之所以會和仁數度一同行動，也都是基於這項目的。也因此，在他們每次行動之後都未能找到糧食時，龍三於是就對「共同對抗蒙古人」的行動價值產生高度懷疑：因為他最重要的目的是填飽幫眾肚子，至於打不打蒙古人，對龍三來說其實無所謂。仁勸誘龍三的行動目的一次次落空，龍三也難怪會逐漸對仁失去信任。鬥笠幫裡已經有一些人餓到沒力氣，冬天也即將到來，為了越冬的準備，龍三的時間壓力可說是非常之大。
而在某次任務中，從蒙古營地救出一批受俘虜的幫眾之後，他自然會從那些「被俘虜時不但有飯吃，還可以唱歌自得其樂」的弟兄口中得知，赫通汗的徵服方針是寬待投降的人。那直接投入蒙古麾下，以及領取針對仁項上人頭的懸賞，就是當下解決鬥笠幫生計的最快方法。
再來是作為浪人。鬥笠幫雖然以武藝自豪，在野漂泊的現實，使得他們充其量不過是群擅長打架的羅漢腳。平時他們也許可以透過協助農家農事、或者擔任商人保鏢，打打零工餬口飯吃，但戰爭直接摧毀了這些本來就不太穩固的生計來源。況且浪人在日常一般民眾眼中的觀感本來就不會多好。到戰時，農民連自己溫飽都有問題，更不可能把米糧分給這些看似遊手好閒的傢伙。
同時，因為沒有武家的榮譽和分封，浪人不像武士，要對封建政權忠誠、要為領地安寧負責。前任鬥笠幫主之所以參與小茂田海濱的抗蒙行動，也許是懷有藉此機會仕進之心，也許純粹是基於衛國攘夷的義務精神，故事對此並未多所著墨，實際動機為何我們已不得而知。然而，在那個還沒有總體戰觀念的十三世紀古代，戰爭仍是專屬於貴族／武士階級的任務。因此當仁從龍三口中聽說前任鬥笠幫主已在戰中以身殉國，才會感到那麼訝異。
雖然仁對龍三表示，在收復對馬之後，可以請地頭志村大人拔擢龍三，但一來口頭承諾空口無憑，即便覺得很OK，志村大人也不見得會答應。更何況志村僅僅作為偏遠邊境：對馬的地頭，很可能也沒有封賞的權限；而鎌倉當局為了封建階級的長期穩定，讓浪人冊封武士的可能性更恐怕微乎其微，八成會是以「於禮不符」為藉口打發掉。二來，眼看蒙古大軍全面肆虐，將之擊退的機率趨近於零（現實當中，對馬也的確是慘遭蹂躪殆盡了）。龍三把賭注壓在蒙古軍上，其實只是經過風險評估做出的合理決策。
第三，身為一名劍客，劍法不俗的龍三必然對自己身手充滿自信，因此會想再跟仁一決勝負是理所當然的。尤其是在龍三和仁之前的閒聊中，我們得知數年前的一場比試，龍三就是因為仁下手不知輕重而難堪慘敗，才失去進入武家擔任護衛或劍術指導的機會，輾轉成為鬥笠幫的浪人。短暫的相處時間裡，龍三就不止一次提起這件往事，想必他是十分的不甘心吧。龍三在後面的橋段，對赫通汗聲稱「仁是對馬最強的劍客」，其實有自抬身價的用意：因為龍三也只有輸給過仁而已。而經歷數年，耿耿於懷的龍三經過一段時間思考，會想利用這次機會來擊敗最強的、證明自己作為劍客的價值，也就不足為怪。
那麼，作為仁的童年玩伴、可以互相打屁聊垃圾話的朋友，龍三在緊要關頭卻如此不念舊情、不惜以打倒仁為目標，是不是有些奇怪呢？事實上，正由於龍三對仁的複雜情感，才使得他背叛的抉擇更加充滿人性。
前面說到，龍三曾經因為比武敗給仁，而和武家公職失之交臂，從龍三就此事件的酸言酸語來看，他對於仁的不滿和自卑，早在那時候便已經埋下原因。這也說明了為何他兩人這幾年來從未再碰面過：顯然是龍三浪跡江湖，乾脆避不見面了。儘管仁作為一個理想武士的化身，仁民愛物，謙和有禮，從來不會因為身份而輕賤任何地位低於他的人，龍三卻很難不因為出身的緣故，而認為自己在仁的面前低人一等。
另一方面，仁雖然是個好人，以武士自矜貫徹四維八德的德目生活著，僵化的武家教育則沒能夠讓他成為善體人意的人。所以當他從龍三口中聽到當年比武落敗的抱怨時，很直接說出：「你當時應該跟我說的，我就會請舅舅幫你謀個職位啊。」此番說詞雖然是好意，但實在太過笨拙。這樣魯直的回應，也許又再一次刺傷龍三的自尊心吧。不只是傷到他作為劍客的自尊，也傷到他作為的朋友的自尊。
投身外來的蒙古勢力，於是成為了龍三意圖超越仁的契機。「不必靠仁的關係說情施捨，我龍三一樣能成就一番事業」——大概他暗自是這麼想的。於是，在生計、名利、尊嚴等等壓力內外交迫下，使得龍三進退失據，才轉而投誠異族，落入了蒙古徵服者「以夷制夷」的策略之中。
除去為了養活鬥笠幫眾的外在動機，或許，龍三想要的，只是希望能和平起平坐，彼此成為他心目中「真正的」朋友。可惜這一切都在其拔刀相向之後，終歸是遙不可及的空想。
金田城下，水燈幌漾，故友反目，刀影寒光。這是《對馬島之魂》第一幕最震撼、也最令人心痛的一節。
整段遊戲流程中，龍三登場的時間其實並不多，但多虧SP社編劇有意識地透過對話和人物互動，自然地鑲嵌大量細節，賦予角色深度刻畫，才得到如此人性化又韻味無窮的演出。在《對馬島之魂》大大小小的故事裡，類似這樣就人物性格複雜的動人描寫，可說是所在多有，有賴玩家用心發掘，細細咀嚼，必然能從中得到更多體悟，和餘韻無窮的情感震蕩。