瑤姬是西王母的女兒，她聰明、善良、美麗，所以西王母十分疼愛這個女兒。
瑤姬從小就喜歡讀書和練武，西王母專門請了文武兩位天師輔導她。瑤姬一學就會，兩位師父就把自己的本事都傳給了她。瑤姬長大以後，西王母封她為雲華上官夫人。
瑤姬從小在天庭中長大，天上所有的宮殿瑤姬都走了不知道多少遍。那些奇珍異寶，瑤姬不知道看過多少回，早就覺得沒意思了。這天，瑤姬在天宮中散步，閒得無聊，便扒開雲端向下看，正好看見蔚藍的東海，水波蕩漾，好看極了。於是，瑤姬背著西王母，帶著身邊的是一個侍女，偷偷地跑到凡間去遊玩。這十二個仙女來到東海，變化成各種各樣的魚、龜、鳥，在海裡盡情的玩耍。仙女們玩的正高興，發現四海龍王正在掀起巨浪給人間造成災難。瑤姬看見百姓們受災的場景，十分同情人間的百姓，就將手中的法器一揮，止熄了海上的風浪。瑤姬帶著侍女來到龍宮找龍王問罪，並警告龍王以後不可以在危害人間興風作浪了。龍王一看是西王母的女兒，便連忙點頭答應了。
後來，瑤姬又偷下凡，到人間遊玩了幾次。有一回，她來到巫山，看見上空有十二條蛟龍正在噴雲吐雨，大地上洪水泛濫，老百姓被逼得沒有活路。瑤姬非常生氣，大喝一聲：「哪裡來的惡龍，竟敢在這裡作孽？」那十二條巨龍看見一個柔弱的女子站在面前根本沒當回事，繼續作孽。瑤姬忍無可忍，拿出法器一掃，十二條巨龍就被斬成幾段，落在了地上。
這十二條巨龍的屍體落在巫山上，變成了幾座大山，把江水都堵住了。
這時大禹剛好在巫山治理洪水，突然看見前面出現了幾座大山，很著急，連忙帶領大家連夜疏通。可是大山的石頭很硬，一時疏通不了。大禹急了，變化成一隻穿山甲，費了好大力氣，才在山上鑽出了一個小洞。可是，小洞馬上又被掉落的碎石填滿了。
大禹不甘心，又叫來了一群黃牛，讓牛群用犄角鑽山，好不容易才弄出一個缺口，可是水流剛過去，又被垮下的山石堵住了。大禹急得團團轉，實在想不出好辦法了。
瑤姬在天上看到了這些，心裡非常過意不去，畢竟是因為自己斬殺惡龍才堵塞了河道。她決定在下去一趟去幫助大禹。於是瑤姬派大力神幫助大禹開山，很快大力神就劈開了這些大山。大禹看見山被劈開了，趕緊帶著手下人疏通河道，順利地將洪水引向大海。
瑤姬知道大禹為了百姓治水不易，決定將三冊天書送給大禹。她命身邊的侍女將天書送到了大禹的手中，叫他按照天書行事。
大禹治好水，爬上巫山山頂，想要感謝神女瑤姬。只見天上雲霧繚繞，根本不見神女的蹤影。大禹找了好久，也呼喚了好久，突然間天空下起雨來，不一會，細雨又停了。這時，從天空中飛過一條金龍，在空中遊來遊去，一會兒就不見了。然後，又有一隻仙鶴從巫峽山頭飛了下來，一眨眼鑽入雲彩裡就不見了。
原來，那些魚、龍、仙鶴都是瑤姬的化身。大禹心想這位女神仙真的是神通廣大，法力無邊。於是他決定親自上天宮跟神女道謝。來到天宮，大禹拜見了瑤姬，瑤姬鼓勵大禹繼續治水，解救水深火熱的萬千百姓。瑤姬還派了幾位天神輔佐他。
神女瑤姬幫助大禹治水的傳說，在巫山一代世世代代傳了下來。後來，人們在巫山上建立了神女廟，好讓後代子孫不忘神女的大功大德。
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