當嫁接苗達2~3片真葉，與嫁接砧木完全癒合好後就應進行栽植，栽植後的溫、溼度管理基本同普通西瓜，唯嫁接苗在以下管理方面應特別注意：
1、注意定植深度，及時去掉嫁接夾
由於嫁接的主要目的是防止土傳病害的發生，因此，定植時應注意定植深度，不可使接穗接觸土壤，以免接穗接口發出新根入土，影響嫁接效果。為了使砧木和接穗完全癒合，且使接穗接口不因定植時傷及而脫落，因此，部分地區農民群眾在定植後才放鬆接口綑紮物或去掉嫁接夾。
接口處綑紮物或嫁接夾去掉得太晚，則會影響秧苗的生長發育，延遲結瓜的時間，因此，定植前苗床檢查傷口癒合程度，及時去掉嫁接夾或放鬆綑紮物，有利於傷口進一步癒合，秧苗定植後緩苗快，發育早。
2、注意砧木腋芽萌發而影響接穗的發育
西瓜嫁接栽培，不論是採用瓠瓜還是用南瓜作砧木，其生長勢均優於西瓜自根苗，特別是嫁接時，砧木根系發育粗壯發達，此時若因嫁接操作時去除砧木生長點不嚴不淨，根系吸收的水分和營養物質由接口處供給接穗的同時，又供給砧木的腋芽或留存的生長點，使其較接穗生長發育速度快而產生腋芽形成砧木的莖蔓葉片，既影響西瓜接穗的生長，又使土壤中的養分和水分浪費。
因此，除在苗床中要檢查抹去砧木腋芽外，定植後要及時、及早去掉砧木子葉間新形成的砧木腋芽，促使接穗儘快生長發育，同時保證西瓜品質不因砧木莖蔓的生長而受到影響。
3、搞好肥水管理
嫁接西瓜因其根系龐大，吸水吸肥力強，如果和不嫁接西瓜同樣施肥，則易引起秧苗徒長，坐瓜困難。所以，嫁接西瓜生育前期，特別是開花坐果期前應儘量少施追肥或不施追肥，瓜坐穩後，特別是瓜膨大期再增施速效肥料，促進瓜的肥大，使瓜大秧壯，保證豐產。
嫁接西瓜施肥量應較普通西瓜減少20%~30%。 採用葫蘆作砧木的嫁接苗，由於根系較淺，耐旱性較差，應注意適時澆水。
4、加強田間葉部病害和蟲害的防治
西瓜嫁接栽培的目的是解決重茬土壤傳播性病害的發生，對葉部病害的發生發展要引起足夠的重視。特別是嫁接苗培育過程中採取高溫高溼的環境控制條件，很有可能使秧苗在苗期就感染葉部病菌，定植時如遇前茬為瓜田，炭疽病、疫病、根線蟲病等病害發生的可能性很大，應加強預測預防，防止病害的浸染流行和發展。