明清時期，六部是中央最主要的機構，地位僅次於內閣、軍機處，負責國家政務的具體實施。對於六部官員的設置情況，很多讀者很感興趣，曾私信筆者詢問，除了尚書、侍郎以外還有哪些官員？這個問題較為繁瑣，所以鋪開來講。
六部設官的種類問題，大致包括這麼幾種：正官、屬官、首領官。六部正官，又叫堂官，就是尚書、侍郎，類似於今天的正副部長。明代是三人，尚書一人、左右侍郎各一人。清代因滿漢復職制，尚書滿漢各一人，左侍郎滿漢各一人，右侍郎滿漢各一人，一共是六個人。
清代的六部堂官品級比明代高，明代尚書正二品，清代到雍正年間提升為從一品，升了一級，低大學士一級。侍郎，明朝是正三品，清乾隆時升為正二品，比明代高一品。實際上，清代很多衙門的官員都比明代高，這裡不細說。
屬官，在六部裡主要是各司下的設官，稱為「部屬」，有郎中、員外郎、主事，這三種官又簡稱「郎員主」。郎中是正五品，員外郎是從五品，主事是正六品。科舉考試取中進士後，如果分配在中央任官，大部分是當主事。再下就是內閣中書，比主事低一品，這兩種官缺都比較多。
「司」在六部中的地位尤其顯著，以最重要的吏部、戶部為例作個說明。吏部分為四個司，即文選司、考功司、驗封司、稽勳司。
文選司掌中央和地方所有文職官員的選授與升遷調補之事，是六部所有司中最重要的。明清筆記提到，吏部排在六部之首，而文選司又排在吏部之首，因此任司官的人以當文選司郎中、員外郎為驕傲。
考功司，掌官員考察，即所謂的京察、大計，關係到官員的獎懲黜陟，也比較重要；驗封司，掌世爵的封襲，文官散階的封贈。散階指的是官員的一些榮譽虛銜，光祿大夫之類的，沒有實職，祖母、母親、妻子也可封為命婦，還可以追封前代；稽勳司，掌官員的守制、終養、出繼、入籍等。
戶部是按省分司，如山東司、江蘇司、福建司，每個司對口掌握本省的錢糧收支。每一個司又兼管一項或幾項專門事務。因為各司繁簡不同，有的省之司清閒，就再安排一些別的事務，明清都是這樣。如山東司，兼管鹽務；雲南司，兼管漕運；貴州司，兼管關稅；廣西司兼管礦政。
首領官乍一聽好像官很大，實際上是正官堂屬下辦理雜務的，另外就是輔佐正官辦理某方面具體事務的。同一個衙門中，首領官的品級一般都比屬官低。比如明代的戶部、刑部，各設照磨所，置正八品的首領官一人，具體事務就是負責檢查公文的署名、日期、用印、字詞有無錯漏之處等等。
清代六部每部都設司務廳，掌收發外省公文，置首領官司務，初為從九品，乾隆三十年升為正八品。此外，還有一些類似司務廳的機構，如當月初，催督所、本房、檔房等。這些機構，都是以本部的司官輪值辦公。
六部還設一些附屬機構，與某一部有關的具體事務，會設一些單獨的機構來辦理，清代六部所設的附屬機構比較多，如吏部設有稽俸廳，專門管理文職京官俸祿諸事；戶部設捐納房，凡是捐官、捐職銜，都要到戶部捐納房交錢。戶部還設八旗俸餉處，專門辦理八旗官兵的俸餉。
禮部設有鑄印局，負責鑄造官印，因為鑄印涉及規格問題，規格就是等級，古代的等級制度一般都歸禮部管。工部設有寶源局，與戶部的寶泉局一樣，都是管鑄錢的機構。再如刑部，增設秋審處，專門查核死刑案。刑部還有司獄司，是管理監獄的。這些附屬機構往往都是雜職官具體處理事務，品級一般是從九品或是未入流。
但不要以為未入流就不是官，明清兩代，未入流是個專門的概念，也是官，是最低的官，會典記載是附於從九品的，就是掛在從九品之下，所以權且可以稱為第十九級，這樣就好理解了。
通過以上介紹，大致可以看出六部的官制設置情況，依次是：最高的堂官，即尚書、侍郎；以下是附屬官，即各司郎中、員外郎和主事；再次是各司之下的首領官，以及附屬各部的雜職官。