世界上最隱秘的圖書館，首推梵蒂岡秘密檔案庫，可能沒有之一。
梵蒂岡作為全世界天主教中心，這座秘密檔案庫，也屬於宗教聖地，也就是大家常說的「聖域」。
在基督教最初草創的幾百年裡，因為實力弱小，被各方勢力驅趕，教眾們生活得顛沛流離，再加上平均文化水平不高，並沒有多少文獻資料存留。
隨著基督教和國家統治相結合，特別是在392年，被羅馬帝國定位國教後，終於鹹魚翻身、權勢日增，不過當時基督教相關文件，通常由神職人員隨身攜帶，一是沒有統一管理，二是沒有指定存放機構。
直至11世紀，基督教完成第一次大分裂，羅馬天主教和東正教兩邊自成系統。
當時在歐洲四處遊走的天主教眾，逐漸有了統一意見，將一些重要文獻或文件，存放於拉特朗宮（Palazzo Laterano）、聖彼得大教堂（St.Peter's Basilica）和弗拉維安宮（Flavian Palace），這也是基督教誕生千年以來，首次有了文獻管理機制。
但是好景不長，在隨後二百年裡，也就是11至13世紀間，三地存放文獻中很大一部分，再次遺失。有人把責任歸咎於教廷搬遷，認為教廷從羅馬遷至法國阿維尼翁（Avignon）過程中，導致宗教文獻失散於各地。
這次教廷搬遷，不但使宗教文獻遺失，還導致了1378年天主教會大分裂。
1378年3月，法籍教皇格列高裡十一世（Gregorius XI）去世，義大利和法國都想控制教皇，於是，義大利選出一個教皇常駐羅馬，法國也選了一個教皇，常駐阿維尼翁，雙方各以正統自居、誓不兩立。
為了彌合分裂，1409年教會召開比薩會議，內部講數協調處理，沒想到這個旨在解決內訌的大會，卻選出來第三個教皇。
教廷內部權力矛盾，從二虎相爭變成了三足鼎立，使得文獻史料管理再次陷入混亂。
諸如此林林總總，圍繞「錢權」相爭狗屁倒灶的事兒，在西方宗教歷史上非常多。
直到1612年，在任教皇保羅五世下令，將現有宗教文獻和文檔，集中形成檔案制管理，這才有了梵蒂岡秘密檔案庫的雛形。
1798年，拿破崙率領法軍南徵，進入義大利後屢戰屢勝，打敗了奧地利和撒丁王國聯軍，逼和奧地利，並且肅清了包括威尼斯和羅馬教皇在內的地方勢力，成功佔據整個義大利。
梵蒂岡秘密檔案庫落入法軍手裡，當時，拿破崙還想把整個檔案館全部搬回巴黎，最後只帶走了一部分重要文獻，這又造成大量文字資料遺失。
PS：拿破崙最著名的騎馬肖像，就是描繪他南徵義大利時的英明神武。
那麼，這座梵蒂岡秘密檔案庫裡，都藏著哪些秘密呢？
整個歐洲歷史，一半兒是天人交戰的希臘神話，另一半兒就是糾纏不清的宗教歷史。
而這座梵蒂岡秘密檔案庫，幾乎集中了歐洲歷史裡，最著名正史和野史的段子。
其中包括羅馬宗教裁判所，因為日心說審判天文學家伽利略的審判書；依諾增爵三世（Innocentius PP. III）發起第四次十字軍東徵的教宗詔書；1312年聖殿騎士團大審判的審判紀錄；1521年馬丁路德被教會開除的教宗詔書；教會要求英王亨利八世取消與阿拉貢的凱薩琳婚姻的訓令，以及米開朗基羅完成西斯汀小堂穹頂畫後，寫信給教會要工錢的原件，美國總統林肯和教會之間來往信件等等，至於大量教皇書信、神職人員日記、教廷帳本等等，更是堆積如山。
根據公布資料來看，梵蒂岡秘密檔案庫裡，僅僅是書架，加起來長度足有85公裡，可供參考的目錄就有35000卷，窮經皓首難以讀完。其中，最古老的文獻可追溯至8世紀末，但13世紀以前的文件，丟的丟、毀的毀，已經很少有存留。
梵蒂岡秘密檔案庫這個「最神秘」稱號，並非浪得虛名，館中大量珍貴一手資料，隨便拿出來幾樣兒，都可以重新定義歷史，特別是1939年之後的任何文件和檔案，都不可以瀏覽，更不允許對外公開，這些內容只能在教皇之間傳承。
據說，這部分文件和檔案，涉及到教會神職人員協助納粹戰犯偷渡南美的實錘。