國家一直鼓勵及大力推進自主創新工作，通過出臺各種政策支持、推動和引導企業進行自主創新活動。
中小企業是數量最大的，也是創新活力最強的群體。中小企業開展自主創新活動可以給企業帶來技術的進步和產品競爭優勢的提升。但是，按照《財政部 國家稅務總局 科技部關於完善研究開發費用稅前加計扣除政策的通知》（財稅〔2015〕119號）文件要求：「稅務部門應加強研發費用加計扣除優惠政策的後續管理，定期開展核查，年度核查面不得低於20%」，並且加計扣除材料需要留存備查10年。如此，則對加計扣除的規範性、真實性提出更高要求，不不處理好為給企業帶來巨大財稅風險。
科技型中小企業的研發費用稅前加計扣除需要如何進行才能避免財稅風險，據信太科技服務研究總結，主要有幾點要求：
1、建立健全企業研發創新活動管理體系，為稅務稽查提供必要保證
稅局對研發費加計扣除的後續核查，主要包括：企業研發活動的真實性及項目技術先進性；以及項目費用歸集核算的真實性、合理性和客觀性，對費用會計處理是否符合要求及具備相關憑證佐證等方面的內容。
企業可以通過建立研發創新管理體系，包括企業立項規範、研發費歸集核算管理規範、項目成果管理及智慧財產權規範等，確保研發活動沒法環節合理可控。
2、規範研發立項管理
企業研發立項不是為立項而立項，需要根據企業產品特性、產品生產、企業發展及企業戰略緊密結合，不能盲目開展。需與企業戰略高度一致，並以增強企業核心競爭力為主要目標。
3、規範研發過程管理
企業研發立項開展過程中對研發進展、成效等按規劃和項目管理要求進行嚴格跟蹤管理。制定匯報機制，確保必須匯報的事項無一遺漏的及時準確匯報。項目周期性報告總結，包括項目實施節點總結、月季年度周期性總結，以及項目驗收總結，需要組織企業內部相關部門及專家進行項目評審驗收，並形成文件。
項目成果進行專利申請或智慧財產權登記，確保成果受保護。
4、規範項目研發支出核算管理
（1）明確研發支出範圍，對研發活動範圍進行明確，對其產生的費用進行專帳管理。
（2）合理、審慎進行研發輔助帳設置以及輔助帳歸集，確保研發費用按照項目明確、清晰、準確、合理歸集，如實反映研發情況；
（3）明確研發過程各部門職責，確保研發過程分工清晰，費用歸集準確。