南宋末年，蒙古騎兵在成吉思汗的帶領下，從蒙古高原崛起，並開創了疆域遼闊的大元帝國。但由於元朝統治者一直秉持著草原治國的思維，所以在短短不到一百年的統治時間內，便被朱元璋給推翻了。
作為曾建立輝煌大元帝國的蒙古人來說，他們有文字的歷史其實很短的。說到蒙古文字的起源，還要從成吉思汗的大力推廣說起。當年的蒙古族，在斡難河流域強勢崛起之初，還是沒有屬於自己本民族的文字。
到了1204年，成吉思汗率軍徵討乃蠻部落，俘虜了乃蠻部落的掌印官，對方名叫塔塔統阿，是一名回鶻人，為人忠誠且有著豐富的學問。成吉思汗出於愛才的心理，沒有殺掉這名俘虜，反而任命他為太子和諸王的老師，教授大家學習文字。
塔塔統阿所教授的文字，最初叫做畏兀字，這也是後世蒙古文字的雛形，史學家稱之為「回鶻式蒙古文」。
回鶻式蒙古文在蒙古地區也幾經起落，忽必烈建立大元朝之後，曾一度提倡「八思巴文字」，但綜合比較，回鶻蒙古文更具有生命力，因此在流傳了幾百年之後，到了十六世紀的時候，回鶻蒙古文正式成為蒙古族通用的文字，當時無論是漠南還是漠北，雖然內部呈分裂狀態，但大家都共同遵守回鶻蒙古文，這一局面一直延續到清朝結束。
清朝結束後，蒙古所屬地區受到了沙俄的覬覦。沙俄為了建立一個和中國之間的緩衝帶，公然挑唆蒙古獨立。也可以說，從沙俄時代起，一直到蘇聯成立後，蒙古地區就一直不是太平靜，中間幾經反覆，後來在蘇聯的刻意謀劃下，外蒙開始獨立，也就是今天的蒙古國。
外蒙在清朝時期，一般被稱呼為漠北蒙古，由於歸屬清朝比較晚，因此在感情上也不是太牢固，加上沙俄的刻意挑唆，又在當年漠北蒙古這裡大肆屠殺封建王公，最終造成了外蒙獨立的局面。
外蒙獨立後，蘇聯方面還是不放心，認為他們和內蒙同宗同源，所以按照「欲亡其國，先亡其史」的法則，決定讓外蒙新使用一種文字，從而隔斷外蒙和內蒙文字上的一致性。因此在上世紀四十年代，一種以西裡爾字母為拼寫的文字誕生了，這種文字的一大特點就是怎麼說就怎麼寫，口語和書面語完全統一，是一種更為全面的拼音文字，語言學家稱之為西裡爾文字。
但顯而易見的是，西裡爾文字的出現，和原先的回鶻蒙古文相對立，嚴重割裂了蒙古族的文化傳承，以至於外蒙的很多民眾，根本不知道蒙古的歷史過往，當然，這自然也是蘇聯方面所希望看到的局面。
這樣一來，就造成了外蒙和內蒙兩個地方，雖然同為蒙古族，卻使用了兩種不同文字的情況。
但近年來，外蒙方面也意識到了使用西裡爾文字的弊端，所以在官方上，他們大力推行原先的回鶻蒙古文，期望能夠重新認知蒙古的歷史，至於效果如何，只能以觀後效了。