臺灣與與祖國大陸的關係，可以追溯到2.5—0.7億年前的中生代時期，那時臺灣和大陸的福建、廣東是連在一起的，直到新生代第三紀（約0.7—0.03億年前），由於地殼運動，臺灣地區地殼下陷，出現臺灣海峽，臺灣才與大陸分離。
但到新生代第些紀（200萬年前），由於冰期來臨，海面下降，臺灣海峽海底現為陸橋，臺灣島又與大陸連在一起。冰期結束後，海面上升，臺灣島再次與大陸分離。考古學家在臺灣海峽海底發現了新生代陸生動、植物化石和古河道的遺蹟，足以證明這段地殼變動的歷史過程。
臺灣2000多萬人口中，大約97％為漢族，基本都是從廣東、福建搬遷過去的居民。在臺灣考古發現的古人類化石「左鎮人」，與北京周口店的「山頂洞人「同屬 3萬年前的古人類。臺灣出土的石器、骨器、陶器，形狀和製作方法都與大陸出土的相似。因此，很多考古學家宣稱臺灣的文化根底在大陸，主要是來自大陸東南沿海地區。
史書關於臺灣的記載也很多，戰國時期的《尚書》《禹貢》篇中就有「島夷卉服，厥篚織貝、厥包桔柚、錫貢」的記載。其中「島夷」就是指臺灣先民。
關於臺灣先民的來歷，中國有很多民間傳說，其中有代表性的主要是以下兩種：一是2300多年前，越國被楚國滅亡後，越王子孫坐船逃到臺灣，後來逐漸繁衍起來；二是2200年前，秦始皇派徐福率童男童女各500人，乘船到海上求長生不老藥。徐福因為找不到長生不老藥，不敢回去復命，因此就讓船隊隨大海漂流，其中一部分就漂到了今天的臺灣，一部分漂到了日本等地，從這個傳說看，日本人祖先也是中華民族。
到了三國時期，臺灣與大陸的交流有史料記載。《三國志》《孫權傳》記載：公元230年，孫權派大將衛溫、諸葛直率萬名水軍到臺灣，準備長期駐紮，可是因為水土不服，僅住了一年就返回大陸。當時吳國有個沈瑩著的《臨海水主志》對臺灣也有記載，可見當時大陸對臺灣已十分了解，並且已有將其納入版圖的考慮。
隋朝時，隋煬帝三次派兵到臺灣，現今臺南西定坊的開山宮、澎八罩嶼上的將軍廟，括說都是紀念隋朝時期將領陳稜的。
唐朝以後，東南沿海居民為逃避戰亂，移居臺灣的越來越多，其中比較著名的是822年，唐朝進士施肩吾率族人到臺灣墾荒定居，並寫下了一首描寫風土人情的詩：「腥臊海邊多鬼市，島夷居處無鄉裡。黑皮少年學採珠，手把生犀照鹹水。」
元朝時期，臺灣正式列入中國版圖，朝廷在澎湖設「巡檢司」，管理民政事務。
1544年，葡萄牙的一艘船隻經過臺灣海峽時，無意中發現了美麗的臺灣島，這是西方國家首次發現臺灣，從此開啟了侵略臺灣的歷史。
1604年8月7日，荷蘭東印度公司艦隊侵佔臺灣，1628年5月，西班牙殖民者侵佔臺灣北部，1642年荷蘭人趕走了西班牙人，臺灣淪為荷蘭殖民地。直到1662年2月，鄭成功收復臺灣，飽受異族侵擾的臺灣重新回到了祖國懷抱。
此後，外族不斷侵略臺灣，1841年8月英國入侵臺灣，被福建水師參將邱鎮功擊退；1884年，法國入侵臺灣，被福建巡撫劉銘傳等擊退；1604年、1616年、1874年，日本曾三次侵略臺灣，均被擊退，然而日本已對臺灣垂涎三尺，處心積慮想要侵佔臺灣。
1894年7月，中日甲午戰爭爆發，北洋水師戰敗，日本以戰勝國的身份逼迫清政府籤訂了《馬關條約》，從此將臺灣包括澎湖割讓給日本。消息傳開，全國人民無比悲憤，到處掀起抗日救亡運動。臺灣人民更是「若午夜暴聞轟雷，驚駭無人色，奔走相告，聚哭於市中，夜以繼日，哭聲達於四野」。從此，日本開啟了長達50年的黑暗統治，直至1945年抗日戰爭勝利，根據《開羅宣言》和《波茨坦公告》，日本侵佔中國的領土，包括東北、臺灣、澎湖列島重新回到了祖國懷抱。
晚年的蔣介石
1949年國民黨戰敗後，蔣介石退守臺灣，形成了臺灣與大陸對峙的局面。
參考：《黨史縱覽》（2000年第三期）之《根基一體 血脈相連——臺灣歷史沿革述略》（阮凌曦）