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Nature Methods發布重磅結果:新測序技術——Ribose-seq
為此,喬治亞理工學院和科羅拉多大學的科學家們開發了一種新測序技術,Ribose-seq。該技術可以鑑定和分析插入基因組DNA的核糖核苷酸,適用於包括人類在內的多種生物。這一成果發表在一月二十六日的Nature Methods雜誌上。研究人員利用這一技術在釀酒酵母的細胞核和線粒體DNA中,繪製了核糖核苷酸的完全圖譜,鑑定了核糖核苷酸插入的「熱點」區域。
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數字微流控技術的基本工作原理
數字微流控的基本機制類似於更傳統的方法,但是所涉及的液體體積要小得多,其流程也高度自動化。 數字微流控技術中,微滴的生成和操作由電潤溼、介電電泳和不混溶流體流動三大原理支撐。 數字微流控技術的基本工作原理 數字微流控技術依賴於由液體表面張力引起的液滴生成。表面越疏水,液體滲透性越差。
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華為發布機器人流程自動化新產品
原標題:華為發布機器人流程自動化新產品 華為在近日舉行的首屆
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Science報導一種新的單細胞RNA-Seq方法
SPLiT-seq 動畫示意|來自YouTube 為促進單細胞分析的可擴展性,來自美國華盛頓大學和艾倫腦科學研究所的研究團隊開發了一種新的單細胞RNA-seq技術:SPLiT-seq, split-pool ligation-based transcriptome
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眾人拾柴火焰高,不斷前進的微流控技術
王進義 西北農林科技大學 題目:微流控細胞操作與組織模型構建 王進義課題組近年來開展了一系列基於微流控晶片技術的細胞操作方法研究,通過系統研究不同種類哺乳動物細胞變形性、微流體慣性微流、晶片微管道內流體力學及微液滴發生動態,建立了多種血液循環腫瘤細胞分離、細胞三維控制圖樣化及人功能組織單位重構新方法,構建了系列高通量循環腫瘤細胞分離與組織仿生分析微流控平臺,促進了微流控晶片技術在生命科學研究領域的應用,尤其是在生物醫學研究領域的應用。
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國內微流控技術:IVD產業最早迎收穫期
微流控技術的誕生,是研發人員對自動化以及效率的最大化追求。而微流控晶片則是微流控技術的下遊應用單元,通過MEMS技術在固體晶片表面構建微型生物化學分析系統,從而實現對無機離子、有機物質、蛋白質、核酸以及其他特定目標對象的快速、準確的處理和檢測。它將需要在實驗室進行的樣品處理、生化反應和結果檢測等關鍵步驟都匯聚到了一張小小的晶片上進行,故又被業界譽為「晶片實驗室」。
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Slide-seqV2可實現近細胞水平的高靈敏空間轉錄組學測序
Slide-seqV2可實現近細胞水平的高靈敏空間轉錄組學測序 作者:小柯機器人 發布時間:2020/12/9 13:16:42 哈佛大學和麻省理工學院Fei Chen和Evan Z.
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非編碼RNA研究技術大盤點
大概流程為:首先對細胞進行交聯處理,將miRNA 及其靶mRNA 與RISC 複合物固定連接;隨後通過Co-IP富集純化RISC 複合物;之後再通過分子內連接將miRNA 的3'-OH 末端與靶mRNA 的5'-PO4 末端連接,形成一條長的單鏈RNA,然後測序。
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Google 開源 seq2seq,通用編碼器&解碼器框架
再現性:使用 YAML 文件配置訓練流程和模型。這也允許其他人運行和你完全相同的模型配置。可擴展性:代碼以模塊化的方式構建,並且易於拓展。例如,添加新類型的注意機制或編碼器架構僅需要最少量的代碼即可修改。
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...seq技術——CoBATCH並解析多器官內皮細胞譜系發育的表觀與功能...
蛋白質和DNA相互作用的染色質免疫共沉澱技術(ChIP-seq)技術是研究表觀遺傳調控的一種重要手段,這項技術可在全基因組範圍內識別順式調控元件和反式作用因子的互作信息,並能構建基因表達調控網絡,從而加深我們對生命過程調控機制的理解。單細胞測序技術目前被廣泛用於研究發育與疾病相關細胞群體異質性和繪製細胞圖譜。隨著技術的發展,這項技術正逐漸將生命科學研究推進到新的維度。
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Seq2seq框架下的文本生成
前言文本生成,旨在利用NLP技術,根據給定信息產生特定目標的文本序列,應用場景眾多,並可以通過調整語料讓相似的模型框架適應不同應用場景。本文重點圍繞Encoder-Decoder結構,列舉一些以文本摘要生成或QA系統文本生成為實驗場景的技術進展。
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MIT創建微流控領域開源網站
近日,一個由麻省理工學院研究者創建的開源網站Metafluidics迅速躥紅,成為「微流控技術領域的Pinterest」 (註:Pinterest是著名圖片分享類社交網站)。用戶能夠免費獲取各類微流控晶片的設計藍圖,從簡單的細胞分類器、流體混合器到更複雜的眼液分析晶片和基因序列合成晶片等。此外,該網站還是微流控領域的社交平臺:所有用戶都可以登錄並提交其微流控晶片設計,並且用戶可以評論、下載網站共享的微流控設計文件並進行晶片製作或設計優化。麻省理工學院媒體實驗室(MIT Media Lab)的David S.
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開發出CiBER-seq新技術,可同時分析細胞中的多達...
CiBER-seq原理示意圖,圖片來自Science, 2020, doi:10.1126/science.abb9662。雖然這項技術將主要受益於對影響感興趣基因的遺傳網絡進行追蹤的基礎研究人員,它也將幫助人們快速找到控制疾病基因的調控序列,並可能找到新的藥物靶點。
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JMC|機器和自動化時代的藥物化學:連續流技術的最新進展
引言義大利佩魯賈大學研究者概述了基於連續流系統、自動化和生物測定的創新藥物化學策略的最新發展,並描述了加速藥物化學發現周期的自動化流程系統和端到端原型的設備和代表性例子。時至今日,LabVIEW已經在儀器控制、系統集成、機器人技術、自動化和資料庫等方面得到了突出性的作用。MatLab是由Mathworks公司發布的一種開源軟體,支持可定製的高級數據分析。大量的工作已經證明了MatLab代碼和LabVIEW程式語言的有益集成,可用於實現反應篩選和優化以及藥物化學目的的自動化和完全集成的流程平臺。
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架構設計:服務自動化部署和管理流程
例如用戶服務需要開發版本為7.0,其他服務可能高於這個版本或者低於這個版本,所以對服務發布這塊做持續集成就很有必要。現在比較通用的服務自動發布和管理的技術棧:Jenkins持續集成工具、Docker容器、K8S容器管理。
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Fastlane 2.122.0 發布,跨移動端自動化流程工具
Fastlane 2.122.0 發布了,Fastlane 是一個針對 iOS 和 Android 全方位開發自動化流程的工具。
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臺灣國衛院研發新型微流控技術,抓取細胞速度快4倍
微流控(microfluidic)技術常見於新藥開發、生醫研究及臨床檢驗等領域,具有成本低廉且檢測速度快等優勢。臺灣國衛院6月17日發表其研發出的「微流控雙微井單細胞培養晶片技術」,相較以往抓取單顆細胞效率可提升達4倍之多,有助縮短後續抗體藥物的研發進程。近日,臺灣國衛院也宣布,已正式完成技轉授權籤約,往後將由元錦生技接棒推動微流控晶片相關應用,加速生技產業的蓬勃發展。
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華為發布全新機器人流程自動化產品:7×24小時不間斷運行
來源:IT之家在月初舉行的技術服務夥伴大會上,華為發布了機器人流程自動化 AntRobot RPA 2.0(Robotic Process Automation,機器人流程自動化)產品。據悉,RPA 作為一種自動化技術,能像人類用戶一樣登錄業務系統並處理數據和業務流,並且可 7×24 小時不間斷運行,提升流程效率和準確性。華為表示,除了電信服務領域外,AntRobot RPA 產品還被應用於華為的製造、供應鏈、財經、零售、IT、HR 等多個部門。
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單細胞轉錄組+蛋白組+bulk RNAseq!多組學繪製全面肺衰老圖譜
文章信息文章:An atlas of the aging lung mapped by single cell transcriptomics and deep tissue proteomics期刊:Nature Communications組學技術:scRNA-seq、mass spectrometry-based proteomics
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麥肯錫報告:智能流程自動化將成下一代運營模式核心引擎,投資回報...
什麼是智能流程自動化(IPA)?本質上,IPA是「將人的機器屬性剝離」。IPA的核心是一系列結合了基礎流程重設計、機器人流程自動化、以及機器學習等的新技術。它是一套下一代商業過程增強的工具,通過移除重複的、可複製的、以及規律性任務來幫助員工。它通過簡化交互和加速流程來從根本上提高用戶體驗。