「AbMole科研」單分子測序全面分析CESC基因組的結構變異

2020-12-19 AbMole生物

AbMole精研抑制劑十年，最新的科研動態不斷與您分享。本期與您分享的是：單分子測序全面分析乳腺癌基因組的結構變異

改進對癌癥結構變異(SVs)的識別，可以帶來更有針對性和更有效的治療選擇，並增進我們對疾病及其進展的基本了解。本項研究中，使用Illumina/10x Genomics、Pacific Biosciences (PacBio)和Oxford Nanopore Technologies (ONT)測序，對兩名乳腺癌患者的SKBR3乳腺癌細胞系、患者源性腫瘤和正常組織體進行了全基因組測序。然後，研究人員使推斷SVs和大規模等位基因特異性拷貝數的變異(CNVs)。研究結果表明，長讀測序技術可以大大提高SV檢測的準確性和敏感性，兩種長讀技術都能檢測到90%到95%的變異。研究人員還報告了即使在相對低的覆蓋率(25x-30x下)，長時間讀取技術表現出了高精度。此外，研究者將SV和CNV數據整合到統一的核型圖結構中，以更準確地表達突變的癌症基因組。在已知的癌症相關基因中，發現了數百個只能通過長時間測序才能檢測到的變異。這些發現強調了需要對癌症基因組進行長時間的測序，以精確分析其遺傳的不穩定性。

Y-27632 (Abmole, M1817，純度 99.66%)是一種選擇性的ROCK1(p160ROCK)抑制劑，Ki為140 nM，比對其他激酶包括PKC，cAMP依賴性蛋白激酶，MLCK和PAK的作用強200多倍。

作者在研究過程中，建立了患者源性腫瘤和正常的類器官。在類器官培養基中，採用了Y-27632這一重要成分。

Y-27632 2HCl是一種選擇性的ROCK1(p160ROCK)抑制劑，Ki為140 nM，比對其他激酶包括PKC，cAMP依賴性蛋白激酶， MLCK和PAK的作用強200多倍。Y-27632也同等有效抑制ROCK-II。Y-27632作用於PKC, cAMP依賴的蛋白激酶和 肌球蛋白輕鏈激酶(MLCK)幾乎沒有活性，Ki分別為26 μM, 25 μM, 和 > 250 μM。Y-27632通過選擇性抑制Ca2+敏感化，而抑制多種興奮劑而不是KCl，包括Phenylephrine, Histamine, Acetylcholine, Serotonin, Endothelin,和Thromboxane誘導的平滑肌收縮，IC50為0.3-1 μM。

鳴謝：Aganezov S , Goodwin S , Sherman R M , et al. Comprehensive analysis of structural variants in breast cancer genomes using single-molecule sequencing[J]. Genome Research, 2020, 30(9).

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