說起古代著名的神醫，華佗絕對是最為有名的一個，他和董奉、張仲景並稱為建安三神醫，醫術全面，尤其擅長外科，精於手術，並且首創了全身麻醉法實施外科手術。只不過讓人可惜的是，華佗的一生，並沒有什麼成果流傳於後世，而他晚年的死因，也成為了一個謎題，但是這離不開一個重要人物，那就是曹操。相傳最後他都是死在了曹操的手裡面，神醫華佗被處決，真的是曹操多疑嗎？其實華佗死的並不冤枉，不妨讓我們來分析分析原因。
《三國演義》裡，華佗死的原因，是因為患有偏頭疼的曹操，讓曾經為周泰療傷的名義華佗來治療他多年的頭痛，但是華佗認為曹操的疾病需要進行手術，為此他提議劈開頭顱，加以麻沸散進行麻醉，為此曹操認為華佗想殺他，便以刺殺的罪名將華佗處決。這個結局和大多數民間傳聞一樣。
華佗自信滿滿的要求執行開顱手術，然而他真的有能力做到？現代第一例神經外科手術，是在1879年，由Macewen 爵士在英國格拉斯哥第一次正式進行開顱手術，他為一患者成功切除了左前顱凹扁平狀腦膜瘤，獲得了良好的效果，此後幾十年，開顱手術的死亡率竟然達到了40%，成為了風險性最大的手術之一，面對大腦這個人體最為精密的器官，人們在小心翼翼的同時，還得增加幾分運氣在其中。而手術成功之後，患者還必須面對到來的術後感染危險，稍有不慎就會一命嗚呼。
很顯然，在沒有專業儀器的古代，要想進行開顱手術，是一件何等荒唐的事情，然而華佗卻說得如此輕鬆隨意，「直接用斧子劈開即可」，也就不難怪曹操為何會生氣大怒，認為他要謀殺自己了。
至於華佗的第二個死因，同樣也和曹操的頭疼有關，《魏書》記載，太祖親理，得病篤重，使佗專視。而華佗在診斷後認為，這個疾病是一個養生病，短期很難治好，即便是長期資料也只能延長壽命，曹操便將其留在了自己的身邊進行治療。
然而時間一久，華佗便和曹操說，自己想回家一趟，曹操同意，結果等到了家，華佗卻有來信一封，說自己妻子病了，多次延長假期不返回，後來曹操三番五次寫信請華佗前來，華佗卻都拒絕前往為曹操看病。華佗妻子真的病了嗎？當然不是。
漢朝的醫生又被稱之為「方士」，屬於比較低下的職業，華佗自認為有才能，厭惡為人役使以求食。（佗恃能厭食事，猶不上道。）這也讓曹操十分生氣，他吩咐手下說道：
「你去打探一下，如果華佗的妻子真的生病了，那麼賞賜他四十斛小豆，並且寬限他的假期，如果他在撒謊，就將他抓起來，交給監獄治罪。」（若妻信病，賜小豆四十斛，寬假限日；若其虛詐，便收送之。）
結果等曹操的手下到了那裡，華佗妻子果然活的好好的，曹操就更加憤怒了，這是關乎我性命的事情，你卻如此懈怠！將華佗關進了許都監獄。
華佗只好老老實實的供認服罪（漢律：1.欺君之罪；2.不從徵罪），曹操明白，此時的華佗就算為自己看病，也不會太過盡心，從而下達了華佗死刑的命令。當時的荀彧十分的不忍心，不由得求情說：「華佗的醫術確實高明，關係著人的生命，應該包涵寬容他。」當時正在氣頭上的曹操卻回答：「不憂，天下當無此鼠輩耶？」而華佗臨死前，將自己的醫書交給監獄，說到：這本書可以用來救活人，獄吏害怕觸犯法律不敢接受，華佗只好忍痛，討取火來把書燒掉了，帶著遺憾而死去。
至於曹操在華佗死後，頭風也始終沒有能夠治好，當時曹操對此卻並不後悔，他認為：就算華佗有能力治癒，他也不會治好自己的病，而是以此得到更高的地位，因此不如殺了他，圖一個痛快。（佗能愈此。小人養吾病，欲以自重，然吾不殺此子，亦終當不為我斷此根原耳。）
這個情節，比起華佗要求劈開曹操腦袋的故事更合理，也能讓人接受，然而這也證明，華佗的死，並不冤枉，就一個醫生的職業道德出發，華佗也應該為曹操的病盡力，他的恃才傲物，也算是害了自己。