政府機構改革和職能轉變在不少代表委員的提案議案中都有所體現，3月10日，改革開放後國務院第七次機構改革方案公布，國務院正部級機構減少4個；撤銷鐵道部，鐵路行政管理職能併入交通運輸部；拆分人口計生委，組建國家衛生和計生委；新聞出版總署和國家廣電總局合併；重組國家海洋局和能源局。國家食品和藥品部門合併，升為總局。結果，正部級機構減少四個，國務院組成部門減少了兩個，剩下25個。
鐵道部撤銷後，拆分為行政管理職能和市場職能兩個部分，實行政企分開。這個機構改革方案，顯然有利於鐵路部門的職能轉變。這個改革應該是歷史的欠帳，很多類似的計劃經濟部門早在15年前就進行了類似的改革，完成了市場化改革的使命。人口計生委也是計劃經濟部門，人口政策是計劃經濟的產物，我們有多少原材料，就可以生產多少產品，能夠養活多少人口，人少了，東西就多了，所以要計劃生育，通過人口控制，大幅度減少人口，來實現致富的目標。改革開放之後，觀念倒過來了，認為我們有多少人，就有多少市場，就可以有多少產能。計生委職能轉型，從人口控制到人口服務，人口服務職能與衛生部類似，拆分後併入衛生部，顯然是適當的選擇。重組國家海洋局和能源局，這是應對當前的能源問題和海洋發展問題，尤其是和周邊海洋權利爭端的現實需要。
因此，這次改革，有的是還了歷史的欠帳，有的目的在於解決當前特定的問題。整體上可以說是穩步推進，並且對今後改革依然留有很大餘地。
今後改革的餘地，主要在於如下幾個方面：
一是國有企業改革，需要取消行政級別。按照行政級別方法來管理國有控股企業，依然是計劃經濟的做法。過去的改革，一個計劃經濟的部門，拆成幾個公司，還是副部級，所以改革實際上是企業剝離出政府職能，但現在很多國有企業依然是很多「二政府」。鐵道部拆分後成立公司，要謹防成立的公司取消行政級別後，人員管理上繼續按照計劃經濟的方法。
二是事業單位改革，也要取消行政級別。按照行政級別的方法來管理事業單位，也是計劃經濟的做法。如很多行政官員在政府部門沒有升官的機會，紛紛轉向這些機構任職，結果是束縛了中國科研和教學的發展。事業單位改革，還需要進一步去行政化。
三是政府自身的改革。政府要強化政策的專業化，不能通過單獨的行政機構來強化部門決策。雖然發改委是國務院決策諮詢部門，但它本身又是行政部門，其決策依然是部門決策。國務院研究室、參事室也是研究部門，但對公共政策的決策，只是輔助性的作用，最後變成了秘書班子，或者點綴。
顯然，未來的改革，取消企業和事業單位的行政級別，政府不依賴行政級別來監管，而重視公共政策的決策、執行和監督，才是重點。機構調整，要儘快解決歷史欠帳，然後在取消行政級別、完善機制的基礎上，重組機構，理順國務院的基本組織職能框架。