江寧將軍是清朝14大駐防將軍之一，全稱鎮守江寧等處地方將軍。駐防將軍是轄區內駐防八旗兵最高統帥，官階最初為正一品，後降為從一品，但盛京、吉林、黑龍江、伊犁、烏裡雅蘇臺的駐防將軍除外，因為將軍轄區不設總督，駐防將軍即為最高長官。
總督是清朝掌管地方一至三省最高軍政和民政的官員，官階為正二品，一般加兵部尚書銜，即為從一品。清朝共有九位總督，兩江總督轄區為江蘇、江西和安徽三省。
至於江寧將軍和兩江總督之間誰地位高、實權大的問題，我們最好先比較駐防將軍和總督之間誰大誰小。
首先從官階上來看，駐防將軍最初是正一品，後來是從一品，而總督則是正二品或從一品。總的說來，駐防將軍和總督的官階差不多，前者略高於後者。所以，如果地方遇有重大事務要上奏，駐防將軍與總督在同城辦公的，二人要聯銜上奏，而駐防將軍的名字應在總督之前。
其次從實權上來看，總督在地方節制綠營兵馬，在行政管理上也擁有相對比較高的權力，轄區一般又地跨數省。而駐防將軍一般不參與民政，只負責節制轄區內的駐防八旗兵。但這種節制權也是極為有限的，因為八旗兵的調動歸兵部，將軍無權幹涉，而兵丁的旗籍又有八旗都統和佐領掌管，將軍亦不得與聞。一旦遇有戰事，軍隊的調動和軍事指揮又要聽從兵部和皇帝。所以，駐防將軍對駐防八旗的節制權相當有限，其實權遠不如總督。
最後從地位上來看，由於八旗兵是確保清朝統治的槍桿子，所以滿清貴族一般不會把駐防將軍這麼重要的官職交給外人，所以擔任駐防將軍者，一般都是滿洲親貴，乃至於總是覺羅。而總督也是帝國高官，地位也是非常高的，但在人選上來源就比較多樣，也未必局限於滿洲親貴，甚至連漢人都有可能擔任總督。所以，從地位上來看，駐防將軍應略高於總督。
不過，具體問題還要具體分析。比如特定地區不設民政官員，駐防將軍權力極大，如盛京、吉林、黑龍江、伊犁、烏裡雅蘇臺五地。官員本身可能在官場上的影響力也不盡相同，這也影響了其在任期間的實權和地位。
但總的來看，駐防將軍與總督可以說是同一級別的官員，權力上可能總督要稍大於駐防將軍，但在官階和地位上一般是駐防將軍更尊貴一些。
而具體到江寧將軍與兩江總督來看，可能兩江總督的權力和地位還要相對更大一些，因為兩江乃清朝財賦之根本，兩江總督的地位和權力也更加尊貴，相比之下江寧將軍就比較落寞了。尤其到了晚清，權力下移導致地方督撫更具實力，像曾國藩、李鴻章等都曾擔任過兩江總督。這時候的兩江總督甚至兼大學士銜，掌管重要洋務部門，門生故吏遍天下，江寧將軍就更加相形見絀了。