我國科學家首次解析綠硫細菌光合作用反應中心複合物冷凍電鏡結構

2020-12-15 中國生物技術網

光合作用是地球上最重要的化學反應,是地球上規模最大的太陽能轉換過程。光合生物利用光能將無機物轉化為有機物同時釋放出氧氣(或者生成硫單質),是自然界最高效的太陽能固定「機器」。綠硫細菌是一類厭氧型光合細菌,誕生在大約35億年前地球的還原性環境,其能夠以硫化物為電子供體進行光合作用(圖1),是最古老的光合細菌之一。

綠硫細菌的光合作用系統整體結構十分獨特,包括外周捕光天線綠小體(chlorosome)、內周捕光天線FMO(Fenna-Matthews-Olson)和鑲嵌於細胞膜上的反應中心(GsbRC)(圖1)。綠硫細菌的光反應中心為鐵-硫型(type-I型),其核心由兩個相同的蛋白亞基構成(即同質二聚體)。在生物進化上,綠硫細菌的反應中心被認為可能接近於地球上原始的光合反應中心【1】。在此之前,地球上已知的光合生物類群中代表性物種的反應中心結構已經被解析,綠硫細菌 (與酸桿菌類似) 的反應中心是迄今唯一結構尚未被解析的反應中心【2】。此外,綠硫細菌的內周捕光天線FMO向反應中心的能量傳遞效率在35%-75%之間,顯著低於高等植物外周天線LHCI向PSI核心的能量傳遞效率 (接近100%)【3,4】,其原因尚不清楚。

圖1 綠硫細菌光合作用光反應系統及FMO-GsbRC複合體空間結構

2020年11月20日,浙江大學基礎醫學院張興課題組與中國科學院植物研究所匡廷雲/沈建仁課題組合作在Science發表研究長文Architecture of the photosynthetic complex from a green sulfur bacterium首次報導了綠硫細菌Chlorobaculum tepidum內周捕光天線FMO-反應中心複合體(FMO-GsbRC)的2.7埃的冷凍電鏡結構。該工作攻克了包括蛋白分離純化困難等在內的諸多難題,首次揭示了水溶性捕光天線FMO與反應中心形成的複合物結構。

複合物內部獨特的色素分子空間排布顯示,內周天線FMO與反應中心之間的細菌葉綠素相隔距離較遠(超過21埃),這可能是導致外周綠小體和內周捕光天線向反應中心的傳能效率較低的主要原因。同時,該工作發現綠硫細菌反應中心兼具type-I型和type-II型反應中心的一些特徵,如綠硫細菌反應中心的葉綠素分子數量較其他type-I型反應中心明顯減少,而與放氧生物光系統II(PSII)核心的葉綠素分子數量接近;綠硫細菌反應中心的天線葉綠素分子(antenna BChls)在中心電子傳遞葉綠素分子[electron transfer (B)chls]兩側呈簇狀排列,與PSII核心的葉綠素排列類似,而不同於其他type-I型反應中心,等等【5-7】。該項工作對於進一步探究光合作用反應中心的進化具有重要科學意義。

浙江大學醫學院張興教授和中國科學院植物研究所匡廷雲院士/沈建仁研究員為論文共同通訊作者,浙江大學基礎醫學院博士後陳景華為論文第一作者。本研究的蛋白樣品在中科院植物所和浙江大學醫學院蛋白質平臺製備;生化實驗在中科院植物所、浙江大學基礎醫學院和浙江大學農生環測試中心完成;冷凍電鏡數據在浙江大學冷凍電鏡中心收集。

原文連結:

https://science.sciencemag.org/cgi/doi/10.1126/science.abb6350

參考文獻:

1. G. Hauska, T. Schoedl, H. Remigy, G. Tsiotis, The reaction center of green sulfur bacteria. Biochim. Biophys. Acta1507, 260–277 (2001).

2. T. Cardona, A. W. Rutherford, Evolution of photochemical reaction centres: More twists? Trends Plant Sci.24, 1008–1021.

3. X. Qin, M. Suga, T. Kuang, J.-R. Shen, Photosynthesis. Structural basis for energy transfer pathways in the plant PSI-LHCI supercomplex. Science348, 989–995 (2015).

4. N. Nelson, Plant photosystem I—The most efficient nanophotochemical machine.J. Nanosci. Nanotechnol. 9, 1709–1713 (2009).

5. P. Jordan et al., Three-dimensional structure of cyanobacterial photosystem I at 2.5 resolution. Nature411, 909–917.

6. C. Gisriel et al., Structure of a symmetric photosynthetic reaction center-photosystem. Science357, 1021–1025 (2017).

7. Y. Umena, K. Kawakami, J.-R. Shen, N. Kamiya, Crystal structure of oxygen-evolving photosystemII at a resolution of 1.9 . Nature473, 55–60 (2011).

相關焦點

  • 科學家報導綠硫細菌光合作用反應中心複合物冷凍電鏡結構
    科學家報導綠硫細菌光合作用反應中心複合物冷凍電鏡結構 作者:小柯機器人 發布時間:2020/11/22 23:53:03 浙江大學基礎醫學院張興課題組與中國科學院植物研究所匡廷雲/沈建仁課題組合作報導了綠硫細菌
  • 我國科學家頂刊發文 解析古老綠硫細菌光合作用反應中心原子結構
    近日,浙江大學醫學院、良渚實驗室聯合中國科學院植物研究所在全球率先解析了一種古老的光合細菌——綠硫細菌的光合反應中心空間結構。該研究刷新了人類對古老光合生物的光合作用機理的認知,對於理解光合作用反應中心的「認祖歸宗」(即進化生物學研究)具有重要的啟示意義。
  • 浙大學者解析古老綠硫細菌光合作用反應中心原子結構
    那麼,是什麼讓綠硫細菌在光照如此微弱的環境下仍能夠進行光合作用呢?綠硫細菌的光合作用系統在結構上和其他細菌又有哪些差別呢?令人感到遺憾的是,儘管綠硫細菌已被發現數十年了,科學家們對它內部的光合作用系統的詳細構造仍然了解甚少。這也使得它成為七大門類光合細菌中唯一一類反應中心空間結構沒有被解析的光合細菌。
  • 我國科學家率先破解光合作用超分子結構之謎
    原標題:我國科學家率先破解光合作用超分子結構之謎【摘要】 光合作用是地球上生命體賴以生存的基礎,對它的科學研究已持續了兩百多年,但仍有很多未解之謎。經過多年努力,中科院生物物理所柳振峰研究組、章新政研究組和常文瑞/李梅研究組通力合作,聯合攻關,通過單顆粒冷凍電鏡技術,首次解析了高等植物(菠菜)的光系統II-捕光複合物II超級膜蛋白複合體的三維結構。
  • 我國科學家率先解析 光合作用超分子結構
    本報訊 記者沈慧從中國科學院獲悉:中科院生物物理所的研究團隊在光合作用研究中獲得重要突破,在國際上率先解析了高等植物菠菜光合作用超級複合物的高解析度三維結構。該項研究工作發表在最新出版的國際頂級期刊《自然》上。
  • 中國科學家率先破解光合作用超分子結構之謎
    據介紹,基於結構的光合作用機理研究具有重要的理論意義,同時也將為解決能源、糧食、環境等問題提供具有啟示性的方案。1985年,德國馬普生物化學所的戴森豪福等首次解析了紫細菌光合作用反應中心的晶體結構,獲得了1988年的諾貝爾化學獎。
  • 上海藥物所等解析糖皮質激素與GPR97和Go蛋白複合物的冷凍電鏡結構
    中國科學院上海藥物研究所研究員徐華強團隊與山東大學教授孫金鵬團隊、浙江大學教授張巖團隊等首次解析了糖皮質激素與其膜受體GPR97和Go蛋白複合物的冷凍電鏡結構,這也是國際上首次解析的黏附類GPCR與配體和G蛋白複合物的高解析度結構。
  • 中國科學家破解光合作用最重要「超分子機器」—新聞—科學網
    柳振峰告訴科學網記者,在單顆粒冷凍電鏡技術幫助下,研究人員發現,該複合體包含25個蛋白亞基、105個葉綠素分子、28個類胡蘿蔔素分子和眾多的其它輔因子,組成捕光天線系統、反應中心系統以及一個能在常溫常壓下裂解水釋放氧氣的放氧中心等三個部分的結構。在此基礎上,光系統II獲取、傳遞和轉換光能的機制也得以揭示。其中,圍繞在複合物外周的「捕光天線」促進了光系統II捕獲太陽能的能力。
  • 原子尺度上的追逐|專訪王宏偉:如何搶佔全球冷凍電鏡先機
    其中,以電鏡為主的複合結構蛋白質組解析系統及功能蛋白質組研究系統的部分設施由清華大學負責實施,冷凍電子顯微學系統是其中的核心設施。該設施籌建之際,高精尖中心尚未醞釀。王宏偉回到清華之後,陸續有更多結構生物學及冷凍電鏡領域的優秀且心懷理想的一批科學家加入進來,這支不斷壯大的隊伍最終創造了中國結構生物學基礎研究持續數年的高產高質量現象。
  • 生命科學學院高寧組報導人源DNA複製起始複合物ORC的冷凍電鏡結構
    ORC2-5和ORC1-5的冷凍電鏡結構,從結構上部分闡釋了人源複製起點識別複合物ORC的分步組裝和逐步激活的分子機制。目前尚不清楚人源ORC複合物分步組裝到DNA複製起點的機制。為了探索人源ORC的組裝過程和功能激活機制,高寧組解析了ORC2-5和ORC1-5兩種複合物的電鏡結構(圖1)。ORC2-5結構中,ORC2-WHD結構域插入到ORC與DNA結合的中央孔道內,從而阻擋了DNA的進入,很好地解釋了ORC2-5功能自抑制的分子機理。
  • 科學家解析出過渡狀態下90S小核糖體亞基前體的冷凍電鏡結構
    科學家解析出過渡狀態下90S小核糖體亞基前體的冷凍電鏡結構 作者:小柯機器人 發布時間:2020/9/22 14:17:36 中國科學院生物物理研究所葉克窮課題組解析出過渡狀態下90S小核糖體亞基前體的冷凍電鏡結構
  • 前瞻·共贏‖水木未來第二屆冷凍電鏡與藥物創新發現論壇
    前言· 水木未來(北京)科技有限公司是一家結構和計算驅動的新型藥物研發公司,創立了亞太區第一個商業化冷凍電鏡服務平臺,已成功為來自中國、美國、歐洲的30餘家創新藥企和頂級科研機構提供了結構生物學和藥物發現服務。
  • 【科技前沿】施一公團隊解析核孔複合物近原子解析度胞質環結構及...
    Ludtke )的核孔複合物結構論文,報導了酵母Yeast細胞核孔複合物低解析度冷凍電鏡結構(),該結構包括552個蛋白組分,整體解析度為28Å ,內環結構20-25Å,當時被認為是最完整的核孔複合物。當時,BioArt在報導相關工作的時候曾預言,「在未來兩到三年甚至更短的時間裡,核孔複合物將會被解析到近原子或原子解析度,從技術上來說不是問題。
  • 科學家首次解析腦神經突觸高精度三維結構—新聞—科學網
    中心主要通過發展和應用冷凍電鏡斷層三維重構顯微成像、高通量全腦三維光學顯微成像、高時空精度的電生理與電化學檢測和智能計算等技術,獲取和分析腦神經系統精細結構和活動的海量數據信息,揭示神經系統信息處理的機制和原理,而這些基礎研究成果除了滿足人類的好奇心,也可能會啟發新一代人工智慧和腦疾病診療技術。」
  • 看清新冠病毒原子圖的冷凍電鏡是什麼利器?
    冷凍電鏡來源大約300多年前,列文虎克和羅伯特·胡克發明了光學顯微鏡,人類首次用光學透鏡窺探到了「細胞級」的微觀世界。光學顯微鏡主要是利用光通過透明介質的折射原理,對光進行聚焦,從而實現圖像的放大。而在上世紀30年代,德國科學家恩斯特·魯斯卡發現電子在磁場下可以發生聚焦的效應,發明了世界上第一臺透射電子顯微鏡。
  • 我科學家解析出新冠病毒細胞受體全長結構
    記者20日從西湖大學獲悉,西湖大學周強實驗室利用冷凍電鏡技術成功解析2019新冠病毒的受體——ACE2的全長結構,研究報告在預印版平臺bioRxiv上線。這是西湖大學承擔的浙江省新型冠狀病毒肺炎防治應急科研攻關任務的重要成果。
  • 科學家創新制氫方法:截取光合作用高能電子,激發化學反應!
    科學家重新進行光合作用以推動我們的未來。2020年5月7日,亞利桑那州立大學科學家指出,氫是一種必不可少的商品,每年在全球生產超過6000萬噸。但是,其中95%以上是通過化石燃料的蒸汽重整生產的,該過程耗能高並產生二氧化碳。
  • 高寧研究組《自然通訊》報導人源核糖體大亞基前體複合物結構
    近年來隨著冷凍電鏡技術的發展,核糖體組裝的研究獲得了巨大的突破,酵母的大小亞基在不同細胞空間(核仁、核質、細胞質)以及不同組裝階段的前體複合物高分辨結構得到了解析,數目眾多的組裝因子的分子功能獲得了一定程度的解釋。
  • 冷凍電鏡首次觀察到單個原子—新聞—科學網
    去鐵蛋白的冷凍電鏡圖譜。圖片來源:Paul Emsley/MRC Laboratory of Molecular Biology 冷凍電鏡產生了迄今為止最清晰的圖像,並且首次識別出了蛋白質中的單個原子。