在《刀劍神域》前兩季的動畫中，劇情往往都是一種皆大歡喜的結局，除了紺野木綿季的死去之外主要角色都能夠在危機中化險為夷，然後暢快地打倒反派，然而到了動畫第三季的時候，我們可以看到劇情虐的程度比起前兩季厲害的多，向著那個悲劇的方向發展了，我們來看看。
一、正面角色慘死
在動畫前兩季的故事中，一般而言正面角色都很少出現死亡的情況，然而到了第三季則是完全不同，在上半季的故事中，作為主角之一的尤吉歐居然在和最高祭司的對決中領便當了，一般而言這種級別的角色肯定是有著什麼主角光環的，就算死了也能想辦法復活，然而動畫中居然就沒有這樣的套路，尤吉歐真的就這麼死了，劇情的進展非常出乎人的意料。
除了尤吉歐之外，像是莉碧雅這樣的正面角色也是很悲劇，這本來是暗黑領域中少見的熱愛和平的人，結果刺殺加百列失敗就被斬首示眾，場面非常刺激，正面角色這樣慘死在刀劍神域的動畫中算是很罕見的了。
二、主角被虐
桐人在動畫前兩季中總是那個威風八面的角色，憑藉著自己的天賦四處裝逼救人，然而到了第三季的故事中，桐人遭遇的打擊一直不斷，在和最高祭司的戰鬥中他就各種被虐，好不容易能夠爆發「二刀流」卻還是因為最好的朋友尤吉歐死去導致的。
尤其是桐人打敗最高祭司之後，還因為他的搖光被電流通過而導致心神喪失，由此桐人再也威風不起來了，他如同植物人一般的被愛麗絲照顧，一直很囂張的桐人居然碰到這種事情，這也是很罕見的。
三、世界觀也很悲慘
在UW世界中，暗之國和人界之間的戰鬥不可避免，根據暗之國莉碧雅等人的說法，一旦發生戰鬥，那就會是過去那個弱者被欺凌的殘酷時代，而她不願意如此，所以對於這個世界的人來說一場大劫難難以避免了，所以這個世界也是很悲劇的。
動畫第三季比起前兩季悲慘了不少，就情節來看更像個悲劇了。