血液透析併發症包括急性併發症與遠期併發症。急性併發症是指在透析過程中發生的併發症，發生快，病情重，需急診處理；遠期併發症是在透析相當長一段時間後發生的併發症，起病緩慢，但病情重，危害更大，需加強防治。
急性併發症
1. 首次使用症候群 過敏反應型（A型）
多發生於透析開始後數分鐘至30分鐘，可有灼熱，呼吸困難、窒息瀕死感、瘙癢、蕁麻疹、腹部絞痛、腹瀉等症狀。發現此反應應立即停止透析，給予抗過敏常規處理，勿將管道及透析器內血液回輸體內。 非特異性型（B型）常發生於透析開始數分鐘至1小時，主要表現為胸痛和背痛，須注意與心絞痛鑑別。可能與補體活化有關。處理原則為：加強觀察，可繼續行血液透析，給予吸氧及對症治療。
2.失衡綜合症
是由於透析過程中血液中的溶質濃度極速降低，使血液和腦組織間產生滲透壓差所致。高效能透析器的使用、超濾量過大、過快等都是促成失衡綜合症的因素。失衡綜合症輕者有頭痛、煩躁不安、噁心嘔吐和肌肉痙攣，重者可發生定向障礙，癲癇及昏迷，常伴有腦電圖改變。這些症狀可在30分鐘內消失，也有致死的報導。對輕者可採用高滲鹽水或高滲葡萄糖液靜脈注射。對長期透析患者則應適當提高透析液鈉濃度進行預防。
3. 透析低血壓
多發生於超濾量過度，血容量不足，應用降壓藥物，使用醋酸鹽透析，透析過程進食等情況。臨時處理可停止超濾或降低超濾速度，將患者放置於頭低腳高位，減慢血流速度，靜脈注射生理鹽水。
4.透析中高血壓
多由於水鈉瀦留、容量控制不當或腎素血管緊張素升高等因素引起，嚴重時可靜脈滴注硝普鈉等藥物治療。
5.心律失常
發生原因主要有冠心病、心力衰竭、電解質紊亂、尿毒症心肌病、貧血和低氧血症。多由於血清鉀、鈣的變化所致。部分患者是由於透析血壓下降，冠脈循環血量減少所致。
6.發熱
多由於致熱源反應或感染所引起。透析開始後立即出現為管道汙染，1小時出現為致熱源反應，可給予地塞米松5mg靜脈滴注，異丙嗪25mg肌肉注射。
7.肌肉痙攣
多由於低血壓、超濾過度、患者透析後體重低於幹體重或低鈉透析所引起。
8.溶血
與透析液溫度過高、因濃縮透析液與透析用水配比不當導致電導度過低而引起低滲血症。表現為靜脈血路中血液呈葡萄酒色，患者出現胸痛，氣短，背痛，紅細胞壓積下降，血漿變為粉紅色。一旦發生應立即停止透析夾閉管路，不回血，以免發生高血鉀。
透析意外的預防和處理
1) 血液透析管路脫落 易引起失血甚至休克，固定管路時，應留給患者活動的餘地。
2) 空氣栓塞 患者可出現胸痛、咳簌，呼吸困難甚至死亡，一旦發生應立即夾閉管路，停血泵，使患者採取左側臥位，頭胸朝下，吸氧，必要時進行高壓氧治療。
3) 透析膜破裂 會導致透析器漏血，須立即更換新透析器或終止血液透析。
4) 管道或透析器內凝血 當患者低血壓時間過長、血流緩慢或肝素化不足時，靜脈端驅氣器中會有纖維素析出，而漸漸發生血液凝固。