翡翠作為礦物集合體，億萬年的演化過程中絕大部分翡翠產生「瑕疵」是難以倖免的，這些瑕疵可分為棉、紋、裂等。
01棉
在水頭較好的翡翠內裡，常常看到絲絮或團狀的白色物體，形似棉花，所以這些內裡的絲絮或團狀物體被稱作翡翠的「棉」，例如冰種翡翠中常見絲絮或團狀的白棉。這些棉大小不一，不過太大的棉容易導致翡翠內裡的結構不夠緻密，降低翡翠的質感，過於集中的棉團也可能影響翡翠的價值與外觀。
翡翠的棉
02紋
晶體較粗的翡翠常常有紋，在粗細不均的晶體交界部位可以看到，原因在於翡翠晶體之間的結合不夠緊密，呈現線條形狀。不過翡翠的紋並非斷裂，而是天然的，只不過影響著翡翠的美觀，但是對翡翠的使用和價值沒有太大影響，並不會造成安全威脅，後期不用擔心因為翡翠的紋而斷裂。當然翡翠的紋不能過多，否則價值會受影響而大打折扣。
翡翠的紋
03裂
翡翠的裂指外力作用下導致翡翠產生的裂口。裂分為表皮裂和貫穿裂，表皮裂顧名思義翡翠表皮上的裂，淺淺的裂紋，不會形成片狀，也不會深入底部，一般是白色的，當然有可能滲著雜色。貫穿裂則貫穿翡翠表面，較長且較深入，甚至可以用指甲摳到。
翡翠的裂
那麼如何區分翡翠內部的棉、紋、裂呢？一、翡翠的棉最好區分，一般呈白色的絲絮或團狀分布，外觀上與翡翠的紋和裂就有明顯差異。
二、翡翠的紋和翡翠的裂相似，不過翡翠的紋不影響光的透射。指甲輕輕划過表面，不會感到粗糙膈手。
三、用手電筒打光翡翠，翡翠的裂會阻擋光線的透射，而指甲划過裂的話，容易感到小小的凸起膈手感。
所謂「瑕不掩瑜」，翡翠上的瑕疵掩飾不了美玉的光彩。區分好棉、紋、裂等瑕疵類型，不影響對翡翠的喜愛之情。