很多人不知道腸道菌、乳酸菌、益生菌有何差別，都是些什麼玩意兒。腸道菌、益生菌、乳酸菌傻傻分不清，那我們就一起來看看他們到底有什麼區別。
由字義上說，住在腸道中的細菌叫「腸道菌」，會產生大量乳酸菌的細菌叫「乳酸菌」，對人體健康有益的菌叫「益生菌」。腸道菌有數千種、百兆只，有相當比例是乳酸菌，數目會隨環境變化消長。但腸道菌有有益菌，中立菌，有害菌，而乳酸菌廣泛存在於自然界，與動植物共生，人類常利用來製造發酵食品，如泡菜、發酵乳等。
益生菌是科技名詞，科學家必須做許多努力，在證明某一株菌是真的有益生效果之後，才能將它叫做益生菌。那麼乳酸菌與益生菌哪個更好？
益生菌大部分是乳酸菌，乳酸菌只有少數菌株可以被稱為益生菌。益生菌是指經過研究、清楚證明對健康有益的、活的微生物，乳酸菌是指會產生乳酸的細菌，二者大不相同。但是為什麼兩個名詞常常被混用呢？因為被證明是益生菌的菌株，絕大部分是乳酸菌，所以講到益生菌時，很自然會聯繫到乳酸菌。相反的，乳酸菌菌種成千上萬，但真正經過研究證明，可以稱作益生菌的不過是其中一小部分。
雙歧桿菌就是典型的益生菌，在發酵葡萄糖時，會產生60%的醋酸及40%的乳酸，嚴格起來說，並不符合雙歧桿菌「產生乳酸需佔代謝物50%以上」之定義。但是，它們的健康形象太好了，又是健康腸道中的重要菌種，所以，我們習慣將它們列入廣義的乳酸菌家族。雙歧桿菌除了乳酸產量較低，其他乳酸菌特性都具有，而它們的形態卻可能是杆狀、球狀、彎曲狀，以及一端分叉的「雙歧」狀，變化多端。
益生菌的菌種菌類及數目越來越少，一般消費者習慣說的A菌指嗜酸乳桿菌，B菌指雙歧桿菌，C菌指乾酪乳桿菌，F菌有人指酵乳桿菌，有人指糞腸球菌。有益菌群主要住在大腸中後段，是腸道健康重要指標。
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