2013年9月：「冠生園」月餅餡料含量不達標
據《重慶晚報》2013年9月17日報導，泰州市梅香食品有限公司以及河北冠生園食品有限公司生產的蘇式五仁、蛋黃蓮蓉等4批次月餅不合格。其中，河北冠生園食品有限公司2013年8月8日生產的商標為「河冠」的蛋黃蓮蓉月餅因為餡料含量不達標而不合格，標準要求餡料佔月餅的70%以上，而該月餅的含量僅為62%。
2012年7月：「冠生園」銅鑼燒酸價超標
2012年7月，三門峽市工商局於第二季度對流通環節銷售的乳製品、肉製品、調味品、米麵製品、豆製品、飲料、方便麵等委託三門峽市疾病預防控制中心進行檢驗。結果顯示，由蘇州冠生園食品廠2012年4月1日生產的一款規格型號為288g/袋的天下一冠銅鑼燒抽檢不合格，主要不合格項目是酸價。
據悉，酸價是脂肪中游離脂肪酸含量的標誌，酸價越小，說明油脂質量越好，新鮮度和精煉程度越好。酸價過高，會導致人體腸胃不適、腹瀉並損害肝臟。
2011年7月：「冠生園」蜂蜜陷"造假門"
早在2011年，一家由新聞工作者組成的「綠籃子」食品安全科普團隊，向承擔我國蜂蜜進出口監測工作的秦皇島出入境檢驗檢疫局遞交了8個樣本。在檢測中發現，8個樣本中5個樣本合格，3個樣本在SM-R檢測中結果呈陽性，為不合格，證明其中摻入大米糖漿，是假蜂蜜。冠生園蜂蜜和中糧悅活枸杞蜂蜜均在不合格之列，以上兩個品牌涉嫌消費欺詐。
業內人士介紹，真蜂蜜有一定濁色，結晶後一般不易再次融化;而不純的蜂蜜一般不結晶，結晶後易融化。而且真蜂蜜在色澤上不如假蜂蜜順眼，消費者容易被賣相好的假蜂蜜「迷惑」。
2010年8月：「冠生園」雪糕上黑榜
2010年8月，蘇州市疾控中心針對全市的冷飲批發部、冷飲超市等開展了專項檢測，在抽檢的75件冷飲樣品中，有11種冷凍產品不合格，其中被消費者熟知的冠生園雪山食品、好家鄉食品、天誠食品等企業上了黑榜。這些產品不合格的主要原因為細菌總數、大腸菌群超標等。而寧波冠生園雪山食品有限公司生產的冠生園脆筒奶味雪糕就在其中。
據《江南時報》報導，當時名單公布後，黑榜上的部分冷飲在南京仍然有銷售。當記者問到，寧波冠生園雪山食品有限公司生產的冠生園脆筒奶味雪糕出現不合格產品，為何在南京市面上依然有銷售呢？負責冠生園銷售的陳姓批發商告訴記者：「冠生園脆筒奶味雪糕不合格的事情沒聽說過。冠生園脆筒奶味雪糕只是自己代理的一個品牌產品，出現了不合格的產品，也只能向寧波冠生園雪山食品有限公司反映。」而冠生園雪山食品有限公司負責人給出的答案是「我們公司是個小公司，而且生產車間也僅有十幾個人。至於不合格產品，估計是工作人員操作不當造成的。」
2008年9月國家質檢總局對月餅產品質量進行了專項抽查，結果顯示，成都市新都區冠生園食品有限責任公司的蓮飄香月餅因產品菌落總數超標而上了此次抽檢的「黑榜」。
2007年9月：「冠生園」月餅檢出胭脂紅
2007年9月24日，重慶市質監局發布2007年月餅質量監督抽查結果，結果顯示重慶冠生園食品工業有限公司巴南分公司2007年8月16日生產的草莓味廣月月餅檢出胭脂紅不合格。據悉，胭脂紅為著色劑,在月餅生產中不得添加。如果長期或一次性大量食用色素含量超標的食品,會在體內蓄積,對腎臟、肝臟產生一定傷害,長期攝入可致癌。
2006年9月：「冠生園」兩批次月餅上黑榜
據四川省衛生廳消息，市場上共抽檢了52個樣品。有5個樣品部分指標不合格。其中就包括：邛崍市臨邛老李家食品廠分別在2006年9月3日和2006年9月4日生產的冠生園伍仁月餅和冠生園雲腿月餅，不合格原因是菌落總數、黴菌記數和酸價超標。據介紹，酸價是脂肪中游離脂肪酸含量的標誌，酸價越小，說明質量越好，新鮮度越好。