洋蔥幼苗定植完成後，就要注意洋蔥的苗期管理了，幼苗出土時揭掉覆蓋物。秧苗苗齊後澆水一次，然後儘量少澆水。苗期可根據苗情施肥1-2次，後期可進行人工除草，種植前半個月可適當控制水分，促進根系生長。
洋蔥苗的管理主要包括間苗，栽培，澆水和施肥，除草，病蟲害的防治等，目的是培育適合年齡的強壯秧苗。 有必要防止幼苗長得太大以至於引起早期抽秧，並防止幼苗長弱和難以越冬。 適宜年齡和強壯秧苗的指標如下：秧苗齡50、60天，秧苗高20-25釐米，葉片4-5片，莖粗0.4到0.7釐米，根系發達，無病蟲害，為了實現這一目標，可以通過控制水分含量來調節幼苗的生長，以使其達到合適的年齡標準。 為了保持土壤水分，播種後可以用覆蓋膜或遮陽網，稻草等覆蓋土壤，以保護土壤，當70％的幼苗出苗時，應除去覆蓋物。
洋蔥種植後，出現了第一片真正的葉子，這就是我們通常所說的發芽期。 從吸收土壤營養到種子的新芽，破繭而出，「拉弓」和「伸展腰部」（出土的子葉為弓形，稱為「拉弓」），出土的子葉直到變直並發芽為止。 它們被稱為「伸出腰部」， 需要潮溼的土壤環境。 因此，播種後，必須保持苗床潮溼，以防止苗床形成幹地面，以確保整個苗期發芽。 通常，在播種前進行灌溉，並且在播種後至「拉弓」和「伸展腰部」階段不需要澆水。 如果播種前底水不足或未灌溉，通常在出苗後澆2至3次。
應根據土壤水分和播種方法的不同。 如果在播種前對底水進行灌溉，則通常不需要在旗苗之前澆水。 在不拉伸子葉之前澆水其他播種方法。 在「伸腰」期間，需要再次澆水。 此後，直到第一片真葉誕生為止，澆水才得到適當控制。 當生長兩片葉時，可以每畝施用3-5公斤尿素並澆水。 幼苗生長過快，應控制肥料和水。 簡而言之，應根據天氣條件使土壤保持溼潤，以防止土壤變幹或變澇。 收苗後要保持土壤乾濕。 一次澆水洋蔥苗，以後儘量少澆水。 根據苗的情況，可對苗進行適當的追肥1或2次，以促進根系的發育並增加15％以上的增產潛力。 播種前半個月應適當控制水量。
葉面噴灑洋蔥可以促進根部發育。 洋蔥從土壤中吸收和轉移磷的過程非常緩慢。 相關數據顯示，從根尖轉移到葉尖需要3到4天，而葉面噴霧劑可以在1到2個小時內吸收並轉移。 為了減緩幼苗的生根，在種植前10到15天向洋蔥幼苗的葉片上噴灑0.2％至0.4％的磷酸二氫鉀可以提高洋蔥的生根能力。
不要在洋蔥育種過程中急於變稀，需要提防常疫病。 在第二片葉長出後和施肥前，應將幼苗稀疏一次，以去除過度擁擠和脆弱的幼苗。 在整個苗期中，每5天清除一次雜草。 生產無汙染的洋蔥通常需要人工除草，但也可以選擇性使用某些化學除草劑。
洋蔥幼苗用50％香茅可溼性粉劑處理洋蔥苗之前，每英畝的量為100克。 種植和收穫期間的劑量（出苗後處理）和出苗前處理是相同的。 可以用水稀釋並噴灑，或撒在土壤上。 配製好的藥土必須混合均勻，攤開均勻，否則容易造成藥害。使用此藥的噴霧器在使用前應反覆衝洗。 還可以通過用水噴灑50％1號除草劑可溼性粉劑來處理土壤，每畝的劑量為150克。 可以適當減少生長雜草的量。 或者，使用100至150克的33％二甲戊樂靈EC或200克的48％琥珀醯EC，50千克水，播種3天後，均勻噴在苗床表面。 注意不要太遲。
加強洋蔥播種後苗期管理
1、播種後應進行苗床管理。 下雨時，應及時檢查田間溝渠系統以消除積水。 在持續乾旱和少雨的情況下，有必要及時噴水以抗旱，促進洋蔥早苗。
2、幼苗長到10釐米時，應及時清除覆蓋的稻草或秸稈，並在晴朗的天除草。
3、出苗後要密切注意病蟲害。 除草2-3天後，用50%妥布津500倍液或75%阿爾伯克散800倍液噴灑一次，以防止幼苗病害。 如果發現地下害蟲，則每667平方米可施用50％的辛硫磷，混合1000公斤的水。
4、及時清除田間雜草。
科學促進和控制秧苗質量直接影響洋蔥產量。
秧苗過大容易早開花， 如果太小，則不利於安全越冬。 通常3-4葉適合移植，並及時施肥幼苗。 幼苗期結束後，在一畝地40-50 kg的尿素，並在移植前5-7天每畝地施用50-60kg尿素。 如果生長趨勢過強，應加強控制，或少施肥或不施肥。 同時，可使用0.2％-0.4％磷酸二氫鉀和0.4％尿素進行外部追肥，以促進幼苗生長。