碧山巖寺，在思明區巡司頂2號。始建於明朝。清乾隆年間（ 1736— 1795年）有小宇數椽，奉祀觀音大士。後有僧慈惠漸次擴建。舊有泉水淙淙，為廈門名泉之一。道光九年（ 1829年），藥酒釀造商「萬全堂」於巖後山石上題刻「碧泉」二字。至清末，巖宇兼祀藥王、吳真人、財神。光緒元年（ 1875年），巖下炮局火藥庫爆炸，殿宇傾塌，藥途行業值年爐主鄭貽謨、福首胡浩然、洪向榮等主持重修。光緒十九年（1893年）復於巖西建新樓一棟，並葺山門、治庖廚。
1927年復傾頹，富商、居士蔣以德捐資修 築。1939年，住持法達法師西歸，無人住持，遂由菜姑黃智海管理寺務。 黃智海職業女子中學畢業，皈依日光巖清智和尚。巖宇兼奉藥王，日常經費由參藥公會補助。上世紀六七十年代，尚有大殿、前坦、護厝達數千平方米，被居民佔用。2001年，仍有18戶居民居住其間。舊巖有崖刻數方， 於今尚存。2002年，由誠信法師任住持並籌資重建，大雄寶殿、地藏殿、 藏經閣次第落成，特別是地藏殿內3米高的天然石雕地藏菩薩聖像，頗具特色。