一項日本研究團隊的研究攪動了人類乳頭瘤病毒（HPV）疫苗的池水。但很快，在論文發表後的一個月多，這項研究因被認為在實驗設計上不合理，遭到同行批評。
日本中止「主動推薦」後，HPV疫苗接種率斷崖式下降。 來源：《科學》雜誌
11月11日，日本東京醫科大學醫學部教授Toshihiro Nakajima在自然出版集團旗下的《科學報告（Scientific Reports）》發表論文。在論文中，Nakajima表示，在小鼠身上注射HPV疫苗和百日咳毒素之後，小鼠出現了明顯的行動不便、腦損傷等問題。之所以注射百日咳毒素是為了讓HPV疫苗能滲透進血-腦屏障，到達中樞神經系統。
12月21日，《科學》雜誌報導稱，有兩個研究團隊已經致信《科學報告》，呼籲撤回該論文。在一份來自比利時安特衛普大學HPV預防控制委員會20位成員的聯名信中，他們指出，Nakajima的研究在小鼠身上使用的劑量為人類疫苗接種劑量的1000倍，並通過注射百日咳毒素來滲透血-腦屏障，這在劑量和機制上都不符合人體的實際情況。而來自澳大利亞墨爾本大學的病毒學家David Hawkes和同事指出，該論文在實驗偏差、實驗數據和結論的一致性上缺少明確的方法和嚴格的控制。
「這是一篇完全無意義的論文，浪費了小鼠的寶貴生命。」美國芭芭拉.安卡馬納司癌症中心外科腫瘤學家David Gorski在博客中如是評價。
對此，Nakajima的回應是「我們的原稿在經過審稿人嚴格的科學評審後，才得以正式發表。」至於1000倍高劑量的質疑，Nakajima表示：「這是（我們在這項研究上）第一篇論文，劑量問題會成為將來研究中的一個因素」。目前，他們正在準備一篇針對批評者的詳細回應。
在回復《科學》雜誌的郵件問詢時，《科學報告》的一位發言人表示期刊正在仔細調查，會採取恰當措施。
而更令部分科學家擔心的是，這項研究結果為HPV疫苗的副作用之爭加了一把火，增加反對HPV疫苗一方的票數。
高危型HPV病毒感染是宮頸癌的致病源。宮頸癌已經成為婦女的一大殺手。據世界衛生組織2015年發布的《子宮頸癌綜合防治基本實踐指南（第二版）》統計，全球每年有超過27萬人死於宮頸癌，其中高達85%的死亡病例發生在發展中國家。
HPV疫苗被認為是目前預防宮頸癌的最有效的方式。從2006年被美國食品和藥品管理局批准上市以來，HPV疫苗已經在超過120個國家被允許使用。2009年，世界衛生組織建議將HPV疫苗用於宮頸癌的一級預防。通用的HPV疫苗有二價、四價、九價，對應覆蓋不同範圍的HPV病毒，分兩次或三次接種，適齡年齡一般認為是9歲至26歲。
但另一方面，在一些國家，女性在接種HPV疫苗後出現了一些副作用，比如慢性疲勞症候群，催生了反對HPV疫苗的群體。
關於HPV疫苗持有不同態度的兩方爭議持續存在，Nakajima的這篇論文被支持HPV疫苗的科學家認為是「偽科學」，會給HPV疫苗的推廣帶來不利影響，可能削減人們對HPV疫苗的信心。
事實上，HPV疫苗接種率的下降似乎成為一種趨勢。在丹麥，在2000年出生的女孩超過90%接種了至少一次劑量的HPV疫苗，但近年來，這個比例正在逐年降低。在冰島，2015年和2016年的接種率也在下降。
在接受《科學》雜誌採訪時，在倫敦大學衛生暨熱帶醫學院負責疫苗信心項目的Heidi Larson對此表示了擔憂，並認為應該對這個趨勢加以警覺。「在衛生基礎設施不健全的發展中國家，HPV疫苗可能是婦女預防宮頸癌的唯一希望。」Larson對《科學》雜誌說。
日本中止「主動推薦」後，HPV疫苗接種率斷崖式下降
日本或許可以稱得上對HPV疫苗副作用爭議最為明顯的國家。
2009年，第一款HPV疫苗在日本得到批准；2013年，日本政府將HPV疫苗納入推薦列表，並免費提供疫苗接種服務。據2015年發表在《柳葉刀》期刊的統計數據，1994年至1999年出生的日本女孩在此期間的HPV疫苗接種率很高，其中1994年至1998年出生的女孩完成三次接種的比例都高達70%。
2013年春天成為一個轉折點，日本NHK等媒體報導，30多位日本女性在接種HPV疫苗後出現渾身疼痛、行走困難、注意力難以集中等副作用。出現此類不良反應後，當年6月，日本負責醫療衛生和社會保障的主要部門——厚生勞動省決定中止對HPV疫苗的「主動推薦」，進行相關調查和評估。
在2014年1月，日本政府公布了調查結果，表示沒有證據表明接種HPV疫苗與上述身體反應之間有因果關係。副作用也在世界其他地方發生，在展開調查後，歐洲藥品管理局和美國疾病控制中心不約而同地和日本厚生勞動省有著類似的結論。
後續的流行病學研究結果表明，上述的身體反應在接種了和沒有接種HPV疫苗的女孩身上，有著相同的概率。
儘管如此，目前，HPV疫苗尚未重返日本政府的「主動推薦」名單，仍在評估中。現在，在被告知接種HPV疫苗的利弊後，日本女性自由選擇是否接種，接種費用仍由政府承擔。
退出「主動推薦」的風波後，統計數據清晰地回答了，日本女性對HPV疫苗的自由選擇更傾向於支持還是懷疑。2000年出生的女性趕在日本取消對HPV疫苗的「主動推薦」之後，她們中的一次接種率跌至10%以下，呈斷崖式下降。
臺灣地區擬推公費接種，明年中國大陸預計上市HPV疫苗
據中國臺灣《聯合報》12月25日報導，中國臺灣「國健署」正擬定擴大中國臺灣地區的HPV疫苗（二價和四價）公費接種，初步將接種對象定為國一（初中一年級）女生，預計每年將覆蓋12萬人，預算金額為2.5億新臺幣。
關於HPV疫苗不良反應，在接受《聯合報》採訪時，醫生周宏學說，中國臺灣地區已經累計接種100萬劑HPV疫苗，「目前不良反應通報有發燒、局部肌肉疼痛等，多屬接種完後正常副作用或集體接種暈針導致」。