兩分鐘測算相機增益(Gain) - 做成像的你不能不了解的真相7

2020-12-27 Photometrics

前幾期真相文章得到了讀者積極的反饋,其中提問最多的就是這個公式:

首先,大家覺得這個公式太有用了。以前只能定性地評價圖像質量,現在一下子就能直接算出信噪比,瞬間高大上了許多有木有。然而,杯具的現實是,95%的人都找不到相機的出廠報告,也就是說並不知道自己相機的 Gain 是多少。不知道 Gain, 那這個公式豈不就成了浮雲啊!

別急,本期我們就來披露分鐘測算相機增益的秘笈,大家準備好打賞哈!

01公式推導

哈哈,公式是煩人的,但也是必須的。

我們知道,當相機工作在光子散粒噪聲(Shot Noise)限制區時:

相機拍到的圖像,亮度是以灰度值(ADU)為單位的, 我們可以用圖像分析軟體(如我們用過的 Image J)計算出感興趣區 (ROI) 的平均灰度值 Mean-ADU 和標準差 SD-ADU (即以 ADU 為單位的噪聲)。

以上公式①變為:

這樣,我們就可以計算出:

以上計算中,圖像的標準差即代表噪聲的前提是,圖像區域內沒有任何樣品結構造成的亮度變化,否則標準差還包含這個結構信息。為此,我們可以連續拍攝兩張同樣場景的圖像,然後把兩張圖像相減。相減後的圖像就只包含光子散粒噪聲了。如果以 SD-subtract 代表差值圖像的標準差SD-image1和SD-image2代表單張圖像的標準差,則以下公式成立:

因為兩張圖像設置完全相同,SD-image1 = SD-image2,所以:

那麼,以上公式最後變為:

這樣算出的 Gain 單位為 e–/ADU。

02拍攝圖像

太好了,公式終於結束了。現在就來拍攝圖像,通過公式⑤,我們知道只需要拍攝3張圖像,就可以計算出 Gain 了。

好的,兩分鐘計時開始哦~

拍攝一張短曝光時間的黑圖像 (bias 圖像) 以計算offset:我們知道,對同一臺相機,偏置(offset)是一個常數。方法很簡單,在相機完全無信號的情況下,(如顯微鏡設為全部光都到目鏡,或者蓋上鏡頭蓋),將曝光時間設為0, 拍攝一幀圖像。拍攝兩張平均亮度大概在相機動態範圍中間區域的圖像。如果您的相機是12bit的,有4096 灰度級,那麼圖像的平均亮度最好在 2000 左右。這個可以通過調整曝光時間,或照明光強度來實現。當然,其實要求並不那麼嚴格,基本要求是圖像上不能有接近飽和(>4000 ADU, 此時相機失去了線性度),或太暗( <200ADU, 此時相機沒有工作在光子信號限制區, 我們計算的條件不滿足)的區域。如果您的相機是 14bit 的,那麼灰度級是16384, 上面的值需要按比例進行調整。

計 算

1. 首先在 Image J中打開 bias 圖像,用 Analyze>measure, 得到圖像的 mean 值即為 Offset。

2. 接下來,打開另外兩張圖片,選擇 Analyze > Measure 得到兩張圖片的平均灰度值;然後再用 Analyze > Summarize 就可以得到平均值 Mean-Image1, Image2

3. 計算差異圖像的標準差:選擇Analyze > Image Calculator,將兩張圖片進行 subtract,並勾選 32-bit (float) result,得到兩張圖片的差值圖像。

選擇 Analyze > Measure 即可看到差值圖像的標準差 SD-substarct:

4. 然後代入前面的公式⑤,我們就可以算出系統增益啦!(表忘了減去偏置值哦~)

計時結束,完美!第一次可能慢一些,第二次做應該兩分鐘都不用吧!

我們還可以設置不同的曝光時間,重複上述步驟,用多次測量所得的值作圖,通過擬合曲線來觀察增益的線性度。Photometrics 官網上還為大家提供了一個使用此方法 Gain 的小工具哦,如有需要,請訪問連結:https://www.photometrics.com/resources/imaging-tools/mean-variance-calculator.php

以上就是兩分鐘快速計算相機增益的方法啦!希望對大家有所幫助。另外我們總結了一些關於 Gain 的事實。

關於Gain的一些事實

CCD/CMOS 相機的 Gain 是出廠設置好的,不會改變;EMCCDEM Gain 會隨著使用老化衰減,正常使用 7~10 年左右;我們推薦每隔一段時間校準一次;

根據廠家不同,Gain 有多種表示方式:有些相機只有一個 Gain ,有些有三個 Gain ,有些連續可調(如 0.5x-20x), 或 ISO100 – ISO1200 等等。以上測試,只對應當時設定的那個 Gain 有效;如果實際使用時,因為樣品或成像方式變化,需要改變 Gain 的設置,對每個 Gain 都需要測量。建議在保存圖像時,在文件名上反映出 Gain 的設置;同一臺相機,Gain 的倍數越大,相機的滿阱容量越小(更早飽和);

同一臺相機,在軟體中調節 Gain 的設置,圖像亮度會變化,但實際探測到的電子數不變,因此信噪比變化不大;Binning 不影響 Gain;

行行好,把測算出的 Gain 值記在小紙片上貼起來供大家使用吧!

如果您有任何疑問,請隨時留言與我們聯繫。敬請期待真相系列下一期~

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