腸道是人體最大的微生態系統和免疫器官，腸道中的微生物總數約佔人體微生物總數量的80％，這些微生物與其所處的微環境、組織、細胞及代謝物一起構成了人體的腸道微生態系統，它們各司其職，相互制約，相輔相成，維繫著腸道微生態的平衡，對人體健康發揮著很大的作用。腸道微生物主要分為有益菌、中性菌有害菌三大類，當有益菌多於有害菌時，毒素等物質就會被排出體外，自身是屬於一個健康的狀態；當有害菌多於有益菌時，有害物質無法排出，在腸道內釋放大量毒素，使腸道會受到損傷，產生病變，導致人體免疫系統會受到進一步傷害，人體免疫力下降會使得機體極易受到病毒細菌的侵襲，從而產生各種疾病。
在此次防治新冠肺炎中，專家認為腸道健康起著非常重要的作用。為什麼會這麼認為？
李蘭娟院士發現，新冠肺炎重症患者通常會出現呼吸困難的症狀，在此時腸道細菌也會缺氧，發生微生態紊亂，容易出現由細菌群移位引起的繼發感染，導致死亡。目前，新冠肺炎的治療沒有特效藥，在防治過程中，除了按照衛健委提出的措施外，還建議按照李蘭娟院士的提議，增大服用益生菌和益生元，用微生態調節劑穩定腸道微生態，幫助有益菌生長，增加腸道內有益菌的儲備量，提高腸道免疫力，預防繼發感染，增強抵抗力，讓人體自身的免疫系統來消滅病毒，才是防治新冠肺炎的穩妥方式。
微生態調節劑主要分為益生菌、益生元兩大類，益生菌屬於「外來菌」，是腸道有益菌的外援，益生元是「原籍菌的口糧」，指不易被消化的食品成分通過選擇性的刺激一種或幾種細菌的生長與活性而對寄主產生有益的影響從而改善寄主健康的物質。我們可以這麼認為，益生元是給益生菌提供的「食物」，能夠被腸道內有益細菌分解吸收促進有益細菌生長繁殖，讓有益菌數量大幅增長，從而抑制有害菌。事實上，益生菌的作用比益生元來得更快些，作為腸道有益菌的「外援」，作用與其並無二致，對於急需大量有益菌儲備的腸道來說，益生菌無疑是最優的選擇，補充大量的活性益生菌，例如嗜酸乳桿菌、雙歧桿菌等，進入腸道，能快速直接的增援腸道有益菌，即刻發揮作用，消滅有害菌，恢復腸道的微生態平衡，從而提高人體免疫力。
李蘭娟院士提出的「從單純殺菌，轉向增殖菌群，在殺菌的同時也要促菌，才是真正改善腸道菌群，提高免疫力的方法。同時她提出的「益生菌免疫激活療法」,是通過口服活性益生菌或益生元，使免疫系統能夠平衡，達到改善過敏及自體免疫細胞的滅菌能力，從而提高抵抗力，預防傳染病，大大地調控起身體內部的抗病能力，對於防控新冠肺炎有著重大的意義。腸道免疫力才是世界上最好的醫生，因此，腸道內的益生菌數量的充足決定著腸道健康，腸道的健康也是自身免疫力強大的基礎。